Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0008700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0124
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:40040072-40040865 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40000473-40001266 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-217.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -232.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 187.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......((((((..(((....)))..))))))))(((((((..(((.((((..(((((((((((((((((((((((((.(((.((((...((((((...)))))).....((((((...))))))....(((((....))))).......((((((((.((((((......)))))).....(((((...((((((......(((((.(((..((((((............(((((......)))))....((((((((((((((((.((((((.....(((((.((((.....)))).)))))..........((((((((.....((((((..(((....)))..))))))....))))))))))))))......(((..(((((((.(((....))))))))))))))))).))))).)))))))...))))))))).)))))))))))...))))).........(((((((...(((.(((........((((..(.((((((((..................((((((((((........))))))..))))(((((....)))))(((((.(((((((....(((((....(((((....((((.(((((((((........))))).)))).))))....)))))..)))))......))))))).))))))))))))).)...))))........)))..)))...)))))))........)))))))).)))).))))))))))))))))))))))))))))..)))).)))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({......,((((((..(({....}))..))))))))(((((((..(((.((((..(((((((((((((((((((((((((.(((.((((...((((((...))))))....,((((((...}}}}||,...(((((,,.,|||}}......,|||||||(.((((((......))))))...|(({({{{{{,.{{,{{{{{||||,,.....,,,,|}}},,...|||,...{{{(({{{{,,|||||....((((((((((((((((.((((((.....{((((.{{{{.....}))).)}}))..........((((((((.....((((((..(((....)))..))))))....))))))))))))))......{{{,{(((((((.(((....))))))))))))))))).))))).)))))}}...,},,,,},,.{(((.{(({....}))}.)))}...,{{{.((((,,{{{{{.,,,...}}}}}||||}}},((((((({.{{..,.....,,.,.,,((((((((((........)))))),.||||{{{{{....}||||(({,,.||||||{,,.{(((((.{{.(((((....((((.(((((((((........))))),}))).))))....)))))...)),..}}}}}))))))),))})))))))))),)}}}))))}}}.............||}}|}}}}}.}}))}..)))})))).)))).))})))))))))))))))))))))))))..)))).)))..)))))))
Forensic Context

No forensic context available.