Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0009400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0107
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40041523-40102699 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40001924-40063100 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-111.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -122.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....(((((.......))))).....)((((.....(((((((((.((..(((..((..........)).)))..)).)))))))))...........((((...(((((...((((((..((((....(((((((.((((..(((..((((.(((.((.((((.(((..(((((((((((.(((...)))..))))))..((((((((....))))))))(((((((.(...(((((.......((((..((((.(((....))))))).))))......(((((((.....)))))))..)))))....).))))))).))))).))).)))).)))))))))..)))..)).)))))))))..))))))))))..........))))))))).(((((..((((..(((((..((...((((((..((((((((......)))..)))).)..)))))).((((.(((...))).)))).....))...)))))))))..))))).....................))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{,{{(((((.......))))),{{,.|(((,....{(((((((((.((..{{{..,{.....,.}..)),))}..}).)}))))}}},...,,.,,(((..(((((.(((({(((((((((((((,{{{({{((((((((.(.((((((,{..,..,},..))))))).)))))))}.,,.,{{,.,,,},|{,,,{,,,.{{((((((....})))}}}}|||||||,{,,,{{{||,,,,,,,{,,|,||||,.,,,,.}.},,,,,)})))).},,,,(((((((.....)))))))))))))))}..))))..)))))..))),|},||||,|,,,|||,.,..,..}})}}}}||,,||{{,..{{|||....,}}},.}}))}.,,,}}.(((((..((((..(((({..{{...((((((..((((((((......)))}.}))).)..)))))).((((.(({...})).)))).....}}...)))))))))..)))))...,}},.......,......,,,)
Forensic Context

No forensic context available.