Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0009800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0074
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:40061554-40062177 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40021955-40022578 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-148.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -160.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((..........))).))).))))(..((((......))))((((((.((((((((((.(((((......))))).).))).....((((((((.((((((....)))))).))....)))))).....))))))..))))))..(((((((((((((..(((....(((((....))))).....)))....))))))))))))).(((((((.(((.......(((..((((.....((((((((.(.(((....)))).))))))))...))))....)))..((((((((((.........((((....((((.(((....(((((..(((((.....(((((((.........((((((.....((((...))))....))))))..)))))))..((..((((((.(((...............))).))))))..))....((((..(((((((.........))))))).....))))..))))).)))))....))).))))..))))...))))))))))............(((((((......))))))))))..)))))))...(((.(((((((((......))))))))).))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(((..........))).))).))))(..,,,,......,,,.((((((.((((((((((.(((((,.....))))).).))).....(((((({(,,(((((....)))))),))....)))))).....))))))..))))))..{((((((((((((..{{{.{..{((,,.,,,|}}}}},,,.))),...))))))))))))}.{((((((.{{{,....,|({{..((((.....((((((((.{.(((....)))}.))))))))...)))),...}))..(((((((({{..,,,..,.((((....((({.(((.{{{(((((..(((((......,{{(((,..,,....((((((.....((((...))))....))))))..}}|||||..((,,((({({.({{...............})).)))}))..}}.,,,{{{{..(((((((,......,.)))))))..,,,)))}..))))).)))))},..))).})))..)))),.,)))))))))).........||,(((((((......)))))))}))..)))))))...{{{.(((((((((......))))))))).))}.....)
Forensic Context

No forensic context available.