Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0010700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0082
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40085435-40132836 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40045836-40093237 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-312.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -333.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.