Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0013600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0151
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40118373-40133995 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40078774-40094396 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-281.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -298.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((((..((......))..))))))(((((((((((((((.(((......((....))......))).)))))(((((((((((....)))))))))....)).......((((..((((((.......((((((..((.(((....((((.(((.((((..(((....(((((((..((((((..((((((((((..(((((((..((.((((((....)))))).))...))).....))))..))).((((((.((......)).)).))))......))))))).))))))((((........)))).(((((((................................))))))).((((((.....(((..((.(((..((......)).))).))..))).......))))))...........))))))))))..)))).))).)))).........))).))..))))))....((......)).)))))).....)))).))))))))))))))))((((((....(((((.........(((.(.(((((((((..((((((((((((((((((((((((....((((((((((((((((......))))..).)))))..)))))))))))))))....((((((..((....(((...((((((((.((.(((........(((((.......((((((((.((((....)))).)))....((((....)))).(((.(((((((......))))))).)))...(((...........)))......)))))...))))).....))))).((((...((..((.(..((..(((...))).))..).))..))...))))............))))).))).)))))..)))))).....(((.((.((((......)))).)))))..))).))))))))))))..)))))))))).)))))))).........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((((((((..((......))..))))))(((((((((((((((,(((,.....,......}..,,,,)}}.))))),{(((((((((....)))))))))....}}.......{(((..((((((.......((((((..((.(((.{..((((.(((.((((..(((...,(((((((..,(((((..((((((({{{,.{{({{{......((((((....)))))),||{|||}|{,..,|{||...,,.{{{{{|,||,.....)),)).}))),.....))))))).)))))}((((........}}}}.,{(({,,......,,......................}}))}}.,,.((((((.....(((..((.(((..{(......}}.))).))..)))..,,...))))))...........))))))))))..)))).))).)))).........))).))..))))))....((......)).)))))).....)))).))))))))))))))))((((((.,..(((((.........(((.(.(((((((((..((((((((((((((({(((({(((.,..((((((((({((((((.....,||||,.}.}}}},.,|||,},,}})}))))....,..{.(((({....(((.{{((((,(((,.{.({{,,......{{{((,,.....,.,..(((.((((....)))).)))....(({|.,,,)))}.(((.(((((((......))))))).)))...{,{,{,....,,..}}},},,..}}}}}..}}}))}}},....}}}}||||}}}|,,{(,........|||...}}},}|{,|,,|,.|....,,||{||}........}}))).)),.,,,,||||))))).,,}}))).||.|||{||,...,}}}.)))),..)))},)))))))))))..)))))))))},)))))))).........))))))
Forensic Context

No forensic context available.