Basic Information
Symbol
hsa_CDK13_0013700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0056
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:40118926-40119681
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40079327-40080082
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-233.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-245.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
134.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......)((((......((.((((((((((.(((((((..(((((.((.(((((((((((((((((((.((((.(((..(((((..(((((((....(((((((((........(((((((....((((((.((((((((................(((((((((.(((.(((((((........)))....)))))))......................(((((((....)))))))...)))))))))............((.((((...)))).))..(((((.((((((((((.........(((((.....(((.......)))..)))))((((..((((((((((((.((((((..((((((.....(.(((((((((..(((((.........)))))......(((..(((((.((((...)))).)))))..)))...)))).))))).)..........)))))).)))))).............)))))))))))).......))))))))))).))).)))))..((((((((.(.(((((.........))))).).))))))))))))))))..((((((..((......))..)))))).(((((..........))))).))))))....)))))))........)))))))))...)))))))..)))))..))))))).))))))))))))))))))).)).)))))..))))))).)))))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....,.,,,||.,|.,.((.((((((((((.(((((((..(((((.((.(((((((((((((((((((.(((,,(((..(((((..(((((((....(((((((((........(((((((....((((((.({{{((((.{{((({,....,{,,{..{(((,,.,,....}}||,......{{{{{{.,,{,...)))),,.....,,,..........,{(((({....})))))))})))}}})))),,..........{{.((({...}})}|||..(((((.((((((((((,....,,},(((((.....{{,.......,,,..))))),((({(((((((((((((.((((((..((((((.....(.(((((((((..{((((.........}})}}....,,{{{..(((((.((((...)))).))))).,))}}}})))))}}))).)..........)))))).)))))).............))))))))))},.......)))))))))))}})).)))))..||||{{{{.{.(((({,,,,,,,,{}}}}}.}.}))))))))))))))),.((((((..{(,.....,),.)))))).(((((..........))))).))))))....)))))))........)))))))))...)))))))..)))))..))))))).))))))))))))))))))).)).)))))..))))))).)))))))))).)),),)
Forensic Context
No forensic context available.