Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0014000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0095
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:40125298-40127930 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40085699-40088331 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-732.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -784.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 745.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..(((.((.((((((.(((.((.((((......)))).)).))))))))).))..)))....)))))))((((((......(((((((.......(((((((((.....(((((((((((.((((((((((((..((...(((((..(((.((....)).)))...)))))....))..)).))))))................(((......)))........(((.((((..........((((((((((..........(((((((.(((((...((.(((((((...((((((.((((.........(((((..(((((((....(((....)))....)).)))))..)))))................(((((((((((.((((.((.((((((.....((((((((..((((((((((((............(((((((((.(((..(((((.((((((((.((((..((((((((.........)))))))))))))))))))).....(((((((....)))))))...........(((((((((.........))))....((((((..((((((((((((...(((((((.((.((((.(((.((((.((((...)).)))))).))))))).)).(((((.......)))))...((((.....))))...)))))))..))))))))))))....)))))))))))..((((((....((((((............(((.(((((.....((((((.....................))))))...))))).))))))))).....))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))).)))))))).....)))))).))..))))...)))))))))))))))..((((.(((((.......((((((.....))))))))))).))))))))))(((.((((.((((((((....))).........((..((((((((.............((((((((((((((.(((...((....((((((((.......))))))))....))))))).))))))).....)))))((((((((.....................))).)))))..(((((...(((((((((.((((((((((.(((.........)))..)))))..)))))...)))))).)))))))).........(((((((........))))))).))))))))..))((((.......)))).............(((.(((((((((((((((.....)))))))..)))).))))..)))..(((((((...(((.((........)).)))...))))))).))))))))).)))..((((((((..............(((..((.((((.((((((((....((((((..........(((((.((((((((...))))))))(((((((.(((..((((((....((....))....))))))....)))...)))))))..............((((.(((..(((((......)))))))).)))))))))...))))))..((........))......(((.(((((.(((..((((..((..(((((((..(((.....)))))))))).)).))))....)))))))).)))((((........))))...((((((((.((....(((((((((.(((((((((((........(((((..........((..(.(((((.(((((((...)))))))...))))).)..))))))).((((((.(.......))))))).....................((((.(((...))).))))(((((((.((((((((.(((((.........)).))).)))..))))))))...))))..)))))))).))).))((((((..(....)..))))))....)))))))..))...))))))))((........)).......)))))))).))))..))..)))..))))))))................))))))).)).............(((..(.....((((((((..(......)..)))))))).)..))).....((((((((...........))))))))((((((...(((((((.....)))))))))))))...........(((((...)))))...(((.......)))..)))))))).))))(((((((((...)))))))))(((((.(((((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))).........((((((....))))))(((((((((((((...)))))))))....)))).........(((((((.((((....((((.(((((((((....)))))))))....))))...)))).)))))))......))))))).)))))))))))))))....)))))...((((((...(((........)))..)))))))))).......))))))).(((((....)))))((((((..........((((....)))))))))).........)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((..(((.((.((((({,(((.((.((((......)))).)).))))))))).))..)))....))))))|((((((,{,...{((((((.......(((((((((.....((((((((((,,((((((((((((..((.,.{((((..{({,({....}}.},},..))))).,,.})..)).)))))),...............(((......))).....,.,{{{.{{{{..,.......((((((((((..........(((((((.(((((....,.((({(({...{{{,{,,{((({{{{{{,,,(,{{({(({{{,{{,,,,{{{,.,,||||...,}}}}}}||||}}||,{{{,,{{{.{{{{{,,{{((({((((,((((,(,.,,,|||,.}|}||||,|||..((({{{{{{|||,..,,,,,,.,||,{||||||.,||},.,,,,.((((((((.((((,.{(((((((.........)))))))))))))))))))).....(((((((....)))))))...{{{{.,,,{{,..,{||,}}}}.,}}}}}}||,|||||,|||{..,,}},.......,,{{{{{{({{{..{{(({.((((.(({{...,}.}})))).})))),,..|||||{|||||||,||||...,((((.....}}||,{{{{|{|({,,{{{{(((((({(({{({...}}},,})}}|||,,,,,.}}}|,,,.}}}}}},,,|{{{{.{{{(({{{,.((((((,.,,.{,...,,...,,,...}}}}}}.},,)))}.,|||||,,|{,..{{{......,))),,))},))))}.}))}},}))}}|||}|,||}}}}}|{|||,}||}}}.}}..}}}}...)))})))))))}})}},{{((,(((({...,,..((((({.,,,.})))}}))))).)))},}}}}}|{{.((((.{(({({((....)))....,|,..{{..((((((((....,,..,,,..(((((((((((({{.(((...((....((((((((,{....})))))))).,..)))))}}.))))}},..,}}))))){{|||{{{,....................))),}}|||..(((((...(((((((((.((((((((((.(((,......,,})},.)))))..)))))...)))))).))))))))....,,,..(((((((........))))))).))))))))..},((((.......))))..,..........(((.(((((((((((((((.....))))))),.}))).))))..)))..(((((((...(((.{{.,......}}.)))...))))))).))))))))).))).,||||||{{...,,..,,......||,|||.||||}|,,||||{.{{{((((((............|.||((((|(((..{||||||||(((((((.(((.{((((((....((....))....))))))....}}}...)))))))....,.........{{{(,(((,,(((((......))))),}},||}|{{{{...(((((((..,{........}}......(((.{((((.(((..((((..((..(((((((..({{.....}),))))))).)).))))....)))))))}.)))((((........)))).....))))))),,,..}|}|||||||||||{,.((((........)))).,...,,||,.|{{..,.(((((.(((((({...}))))))...)))))....||||||..((((({.{.......}))))))...,,,,............}|||||}|||}..))).))))|{{{|((.((((((((.(((({.{......,)),))).)))..)))))}}}...)))}.))))))))}.|{{,{{(((((....))))).,)),))),...,,((((....,}}}},}}}}))||,|||.,,,}||,...,,)}))))))}}}}|..,|||..},})))}|||},{....,,....}||}}}}}|||,||{{,.......,,.(((.,{,,,..{{{{{|||,.,..,,,,},,}}}})))).}..)}),....((((((((...........)))))))}{(((((...(((((((.....))))))))))))},,,........{{{||,,,)))),...(((.......)))..)))))))).))))(((((((({...}))))))))(((((.((({{.(((,...,))).}))),)))))...........)))))))))).........((((((....)))))){(({(((((((({...}))))))))....)))}.........(((((((,((((....((((.(((((((((....)))))))))....))))...)))).))))))),.,))})}))})),)))))))))))))))....))))}...((((((..{(({........))},,)))))))))).......))))))},(((((....)))))((((((..........((((....)))))))))).....,,},))))))}
Forensic Context

No forensic context available.