Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0050898 hsa_circACTN4_002
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
19:39138267-39219794 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38647627-38729154 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1046.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1087.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 906.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((((((((((..((.(((...((....))))).))..)))))))..((.((((.(....((((.((.(((..((..((((((.(((((((........((.(((...(((((...)))))))).))...(((((((((((((...(((((((((.(((((((((((((...((((..((((((((((((((((..........(((((........))))).(((((.((.......)).)))))..((((((..(((.((((..............)).)).)))..))))))(((((.....))))).......(((((.....)))))(((....((((...)))))))..))))))))))))))))...)))).....((.((((((((.((((.(((.(.(((((.(((((((((.((.((((..........)))).)).....(((((.(......))))))...((((((..(((((((..(((((((......((.(((((((.((....))......((((((((((.(((.(((((((((((.....((((.(((((.(((((((....))).)))).....(((((((.......((((((.(((((((....))))))).))..))))(((......)))(((((..((....(((((((....).))))))..((((((((((...................)))).))))))..))..))))).........)))))))..)).))).))))(((......))).....(((........)))((((......)))).........(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).)))....(((((((...((((.(((((((((.(.....((((((....)).(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............((((((((((...((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((((((...((((((...(((((..(...((((((((.((......))))))...))))..)..))))).))))))((((.....)))).....))))))......)))).)))..)))...))))).)))))).))).))))))))))).))))))).)))))))...(((((((.(((.((.((((..((..((.((..((((((.(((((.(((((((((.....((.((((...((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))((.((..(.....)..)))).(((....))).)))).))...)).))))))).)).)))........))))))..)).))..)).))))))(((((...(((.(((((.......)))))..))).)))))......)))))))))))))))).).)))..(((.((........)).)))))))))).))....))))))).((((...)))).)))))))..))))))((((((((((((........((.(((((...))))))).....)))))).((((((((..(....)..))))))))............(((.(.((((..(.((.((((.....)))).)).).))))).))).((.((((((((...((((((((..........((((((((((...(.((((((((((...((((.....(((...(((((..(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)).))).)))))....(((((((.((((.((..(((((................))))).)).)))).....((((((.((.....)).)))).))...(((((..(.((.((((..((.((((............))))...))..)))))))..))))).......)))))))...)))))...)))....))))..)))))))))).))))))).))))))))))))....)))))))).)).))))))((((..((.((.((......)).)).)))))).......(((...((((((...(((((.((....)).)))))...)))))).))).)))))))))........((...(((.........))).))...))))).).)))))))...)))))))).)).))))))))))).........(((((((....)))...)))).(((((((.(((...))).)).(((.(((((..........))))).)))((((((.............))))))....)))))))))))))))).((((((........)).))))......))))..)))))).))).((((...((((........)))).))))...))).)))).))))))..))..)))..)).))))).)))).)).))))))..))))....)).)))(.((((.(..((((((...((...(((..(((.((((...)))))))..))).))..)))))).....).)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({(((((((((((((((((((..,|,(((,..({((((((.((((((((,(((((((({,.{((|(((|.((((,(((((..(.(.(((.((((((((....(((.({(((.(((,..(((((...}))))}}).))...((((((((.((......(((((.((.,(((.(((....,,))).))})).))))).,|.(((((.,.....,.)))))...)))))))))){.(((((.((.......)).)))))..{(((((..(((.(({(.,..,....,,..,)).)).)))..)))))}(((((.....)))))....,..(((((.....)))))..},.,,{(((...}}}}({{.((((..((((((((((((({(((......((((.(((((..(({..,(({{..{((((((.,..,...((.((((..........)))).})...((((((((.((((((.((((...((((((,..(((((((((((((((((((({,{,,.{(,(({.,{{{,.|,||,,((((,.{{{{({..{{,|,|{{{{{|||,|||||.|)|}}},}.|||||||,,}}}||.|||,.{{,.,,||.,}}}.))}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,,,...,}},,..}}}}}....((((((,....}.))))))}}}}||}},{{||||..||||||||,.....|||,.,|.||..((((..{{......,,..))))..}|.,{(,{{..,.}}||......,}}......(((||,....,))}{({{......)))}.,.,,,...(((.((((((((((.(((.{,((((....,,|{{{{(,,,...}}....)))),,.))).))).)))))))))).)))..,.,|||,{{||,}}.},).,)))))),,...,))))}))...,,,.|||||.(((((((.(.(.((......)).).).)))))))})))))}}.}}......,))),)},,))).))).))))))))))))))))))..,.))))))).))))})))))))...))))....)))).))))))),..})))))..)))),)))..)))})))..)))))))).))).).,...)))))...((((({{.....,||||{{{(({{(,....}})),.},.)))))}..,,..,))))))))))))..})),))))))))}.))))){{{(((({(,.,.||{||||||,,.(((.{.((((((((((((((((...{.,({((.....|)})).}...))))}})))))........,((((((((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))...))).))),.....))))))}.))).,,.||||}}}|,,,.,.,{|{{,.....|||,.,.||..,|}||||..,{....|{.,|}||||||,|}|,{|||,{|||}}||.,.,,})}.,}}}})))})).}.})))))),}))))|{,{{(((((...}}))}{.........,..{{{{{{...({{..{{{..(((..((({...)))).,))).)))}))}|||},,|||((((((........|{.|||||..,))|||},.....)))}},.((((((((.,{....)..)))))))).|||||....}|||..||||,|||,|||||,|......{{({(({.,.((.((((((.((.((((((((...{(((((((,,........((((((((((...(.((((((((((..{({{(,.,..(({...(((((..(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)),))).)))))....{{{{{{,,({{{,{{.{(((((......,....,,...|||)).}|.||||,.{,.{{((((.((.....)).)))}|||{{{(((((.,(.((,({((..({.{{{{,,......},..)))),,,}),.)}}}|||..}}}))}....,,}))))))...})}}|...}}}....})))..)))))))))).))))))).)))))))))))},...)))))))).)).{{(({(((((.,(,.((.({......)).)).}})))).}}.,..(((...((((((...(((((.((....)).)))))...)))))).))).,,,.,},.,},......,.............)))))).)).,,)))}.((((({(((((((....)))).))),,...)))))).||.|{...{,{{{{{....}},..,)}}).})))}||}||,...))).,,.{||,||,{{.,,,|}.,|.}}})),)))||||||,..|||,,|,},..,}))}.,}})})))),||}}|||{|,{{{{,{|||..|||||{||||.,|,|||}||}||.,,,,||||.{..||.}||||.,}|}},}))||.||||..}}}}.,}.)}}})}}|}}}|,,|||..,,..,|,|||||||{|{|||}},.||||,...,|{.,|||.{||||.|({...}).,})}}},)),..,))))},,})))))}}}),}},},},,,))))}}.}..}))),,..)
Forensic Context

No forensic context available.