Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0551100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDYL_0102
Host gene
CDYL
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:4904083-4905932 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:4903849-4905698 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-598.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -635.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 345.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((...((((((((((((((((.....)))))))).))))......(((((....((((((.(((((((........))))..(((((((.(((.......(((((((...(((.(((.................)))...)))..)))))))(((((((......(((((((......(((.((((((((....))).......(((.((((((((((........)))))..))))).)))..((((...((((.....)))).))))((((((....)))))).(((((((.......)))))))))))).))))))))))((........))...(((((((.(((((((...(((((((..........)))))))...((((((........)).)))))).))))).)))..)))).....((((((((((.........))))))))))..)))))))((((....(((((..(((((((((....((......))....))))....((((((...(((..(((((........)))).)..)))...))))))((((.(((....))).))))))))))))))...)))).((((((...(((....))).))))))))).))))))))))))))))...)))))(.(((((((.(((((((((.((((.(((.((.(((((....))).))..))))).)))).)).)))))))...((((.((((((((((((..........))))))))).(((((((.((....(((.((.(((.((((((((((((((.((((((.((((((((.((((((((((((((.....))))).))))..(((.....)))((((((...(((((.........)))))...).)))))..(((.(((..(((........)))..)))..)))))))))))))))).)...))).................)).))).).....)))))))))).))).)).))).....)).)))))))...(((((((((......(((((.....(((((((......))))))))))))......)))))))))........(((((((.......((((((.((((((.((....)).)))))))))))).)))))))...((((..(((((((.(((.(((((((..((((((..((.(((...........((((((....))))))..........(((........)))........((((.(((((((.....))))))).))))(((((((((.....)))))))))......(((((((((((.((((....(((((((((...((...((((....((((...((.((((((..(((((((((.....)))))(((((((...(((((....))))).....))))))).............)))).))))).).))....))))))))...)).)))))))))................))))..)))))))))))((((((...(((.......))).....))))))))).)))))))).)))))))((((((...))))))((((((..((.(((((((..((((...)))).))))...)))..))...))))))......(((((((.((....)))))).)))...))).))))))).))))..(((((((((.....))))))))).))).))))..))))))).)....(((((((((((((...)))))))..(((((((......)))))))(((..........)))....))))))..))))..)).)))((((........)))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((...((((((((((((((((.....))))))))},)))....,,(((((....(((((,,(((.(((,{{,...{||||..,({{(({,{(((.......,))}}}.,,}|}||||.......................|,},.}}|{{(((((((((......(((((((,.....{((.(((((,{(....}})}......(((.((((((((((........)))))..))))).)))..{(((...((((.....)))).)))}((((((....)))))).(((((((.......)))))))))))).)))))))))),,.,,....{{{{{.,,|||||.|,,||{{,.,({{,,{{.,.,...|{{||||}|,{{{((((((........)),,))),,})),}}.)))}})),},....((((((((((.........))))))))))..))))))))}})}}|,|{{{{{,{(((({,(((({{,,....}}))),..},......((((((...(((..{((((........)))).,..)))...)))))){(((,({{....})),))))))))}}))),.|{|,.,,||||,,..{((({{{..,,.))}})))),.}}))),)))}))))))...)))))|}(((((((.(((((((((.((((.{(({((,(({{{....)))}))..,,}}}.)))).))}}))))))...((((.((((((((((((..........})))))))).(((((((.((.,..(((.((.(((.(((((((((({(((.{{((((.((((((((.(((((((.{,,,,({{.,{|||||{|||,.,{(({{{..,,,((({((,..(((((.{.....}.)))))...}.)))))..|||}}}}}}}})))......,}))))....,))))))))))))))).)...}}}............,,...)).)}).).....)))))))))).))).)).))).....)).)))))))...(((((((((......(((((,....{((((((......))))))))))))......)))))))))........(((((((..,,,..,{{(((.((((((.{,....}}.)))))))))))).)))))))...((((..(((((((.(({.(((((((..((((((..{(.(((...........((((((....)))))).....,,...(((........))).......,((((.(((((((.....))))))).))))|{(((((((.....))))))))).,....(((((((((((.,{{((({,(({{{{(((.,,((...,{({,,..{(((,..,{.,||||{..||||({{{{.....}}}}}(((((((...(((((,....})))}.,},)))))))........||||,}}}),))))}.},}}....}))))}),,.,)),)))|||}||.........,,.,,}.,,,}..)))))))))))((((((,,.(((.......)))..,}.))))))))).)})))))).)))))))((((((...))))))((((((..((.(((((((..((((...)))).))))...)))..}}...))))))........|||,,.{{}},.))))}}}}),...})).))))))).))))..(((((((((,...,))))))))).))).))))..))))))).,....(((((((((((((...))))))),.{((((((......)))))))(((.,,.......}}),,..})))))..))))..)).)))((((........)))..}
Forensic Context

No forensic context available.