Basic Information
Symbol
hsa_ACTN4_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0050901
hsa_circACTN4_005
hsa-ACTN4_0085
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:39191240-39200982
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38700600-38710342
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-208.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-221.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
162.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((....((((((((....(((((.(((((.....))))).................((((((..(((((((.((..((((...(((....)))))))))))))))).)))))))))))(((((.....))))).....(((((.(.((((.(((((((..........))))........(((((.(......))))))...((((((..((((((....(((((((((((((...(((((........))))).((((..(((((..(((...((((((..........)))))).)))))))).))))(((.(((..((....))..))).))).((((((.(((((((....))))))).))..))))....(((((.((((...........(((((((....).)))))))))).))))).))))..)))))))))..)))))).....((..((((..((......))..))))..))...)))).)).(.((((((...((((.......))))...))).))).)..))))))).).))))).(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).))))))))))).....)))..(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((,...((((((((,...(((((.(((((.....))))).......,,,,,.....|||||{..((((((({,(..((((...(((....)))))))})))))))).}}))},)))))(((((.....))))).....(((((.{.((((.((,((((..........)))).,,.....(((((.(......))))))...((((({..((((((....(((((((((((((,,.(({((,,.,,,,.|}}}|,(((({.{{{{({..{,,},|{{{{{|||,|||||.|)}}}}}}.|||||||,,}}|||.|||..|{,.,.}}..))).))}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,{{.,.,||,|..}}}}}....((((((,....}.))))))}}}}|}}},,,))))..)))))))))..))))))...,,||..((((..{{......,,..))))..}|..,|}||.}}.||||{,.....}},.,...|||,,,....,)))},,....,}})))).}.))))).(((.((((((((((.(((.{{({((.....,{{({{(......}}....))))...))),))).)))))))))).))))))))))).....})).,,.,....}
Forensic Context
No forensic context available.