Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0050902 hsa_circACTN4_006
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:39191642-39212518 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38701002-38721878 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-498.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -523.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((.....)))))(.((((((((.(.((((.(((((((..........))))........(((((.(......))))))...((((((..((((((....(((((((((((((...(((((........))))).((((..(((((..(((...((((((..........)))))).)))))))).))))(((.(((..((....))..))).))).((((((.(((((((....))))))).))..))))....(((((.((((...........(((((((....).)))))))))).))))).))))..)))))))))..)))))).....((..((((..((......))..))))..))...)))).)).(.((((((...((((.......))))...))).))).)..))))))).).))))).(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).)))..((.((((((((......).)))))))))...(((((((((.((((.(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............((((.(((((...((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((((((...((((((...(((((..(...((((((((.((......))))))...))))..)..))))).))))))((((.....)))).....))))))......((((.....))))..((((...(((.((.((((((...)))))).)).))).)))).(((.....))))))))))))..((((.((((((((.(((((.((.(.....(((..(((.(((((((..((((((((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))...))).)))...((.....(((((((((..(((...........))).....)).)))).))).....))))))))))))..)))))).)))))..((((..(((((((((...(((.(....).))).))))......((....))))))).))))......(((.((((.((((............)))))))).)))..)))))))))))).)))))))))))))..))))(((((.......)))))..(((((((((..((((...((((......)))).))))..))))))..))).((((((((((((((...)))))))))))..))).))(((...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,.(((((.....)))))..,{,(((((.{.{(((.((,((({..........})))..,...,,(((((.(......})))))...((((({..((((((....(((((((((((((,,.(({((,,.,,,,.|}}}|,(((({.{{{{({..{,,},|{{{{{|||,|||||.|)}}}}}}.|||||||,,}}|||.|||..|{,.,.}}..))).))}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,{{.,..||,|..,}}}}....((((((,....}.))))))}}}}}}}},,,))))..)))))))))..))))))...,,||..((((..{{......,,..))))..}|..,||||.}}.||||,,,....}},.,...{||}},....,)))|||,....,,)))).,.))))).(((.((((((((((.(((.{{({((.....,{{({{(......}}....))))...))),))).)))))))))).)))..,,.{|(({{,(,{{{,.|{||||||||,...((((((((,,((((.(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............(((,{(((((...((((((((.,(,.,..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).......,),.)))))))).((((((...{(((((...,{((({{(,,((,,,((((.({......))))))..,)}))|.),,},,,|.)))))|((((.....)))).....))))))......{|((,....}}))..((((...(((.((.((((((...)))))).)).))).)))).,,,......},)))))))))..{(((.((((((((.,..(((((.(,.(({((((({((,{,.,,,{.{((({,.((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......))))))|{{.||..|||...|,.,|}}.{{(,,..}|,,|{||.||..,,|.||||||.....|||,...||..||}||||.,|||...|,..}}))})))}},{.{{|,{{{{|||||.,.||}}|.,}}})))),,)}}.},)).}))}}}.)),.),,))))......(((.((((.((((............)))))))).)))..)))))))))))).))))))))))))),,,}||((((({{..,,,}||},..||{((((((..((((...((((......)))).))))..))))))..))).|||,{|||||||{{,,.}))})))))))},)}).)))||...,})
Forensic Context

No forensic context available.