Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0016100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0036971 hsa_circCHD2_020 hsa-CHD2_0089
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93480748-93492306 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92937518-92949076 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-256.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -275.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((....))....((.(((.....)))...))......(((((((......((((((((....((........))...((((((.(((((((((((((((((((...(((......(((.((((....))))((.((....)).)).......)))......)))...))))))))..).))))..(((((((..(((((.((......(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))).(((((..((((....(((((..((.((.....((((.....))))....(((((((...)))))))....((((((..((((.....((((....((((..((((((((.((((.(((....))).)))).......(((...)))....))))))))..))))....((....))(((((.((((........)))))))))..((((..((((((.((((((.(((.(((((((((((.((((......(((((..............(((((..((((.......))).)..)))))........))))).............((((....((((..((((.(.......).))))..))))....))))...((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((....((((((....))))))))))))))))........)))).)))))))....(((((..(((((((((.....))))))........)))..)))))....)))))).)))))).....))))))))......))))..)))))).(((((((.(((......))).).))))))..........)).))))))).....))))..))))))).)))))..)))))))......))))))...)))))).)))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......{(....}}....,{|(((.....))}...}}......(((((((......((((((((....{(........))...((((((.(((((((((({((((((((...(((......(((.,,{,.....||,((.({....)).)).,.....)))......)))...))))))))..).)))),.(((((((..(((((.(((.....(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))){{{((((.,,,|}}}}}....((((..((((..(((((((..........{((((((...))))))}....{(((((......}))))),,,....((((..((((((((.((((.(((....))).))))....,..(((...)))..,.))))))))..))))..,,{{....,,((((,,((((........))))))))).,|||,.{(((((.((((....(((.(((((((((((.((((.,....{{{{|....,.........(((((..((((.......))).)..)))))........||}},.....,}......{(((.{..((((..((((,{.......).))))..))))..}.)))}...((.(((((((((...{((,....}}}....||............((.((..(((((.(((((...{{..(((({...}))))...,,...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((,...{(((((....)))))))))}))))))........)))).))))))))))).,))))))},|(((((.....))))),.....)))))))..))))..)))).{,.....,}.......,.((((..(..(({.(((({,((,..(((((((.(({......})).).))))))..}......))))))).)))..)..)))),....,))).)))))..))))))).,....))))))...)))))).)))))))))))))))..
Forensic Context

No forensic context available.