Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0019600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0036977 hsa_circCHD2_028 hsa-CHD2_0321
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93485052-93524687 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92941822-92981457 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -708.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 637.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.((.(((.(....((((((.....))))))).))))).))).))((((((((..(((((((.((...(((((((.(((((((...)))))))....((((((..((((.....((((....((((..((((((((.((((.(((....))).)))).......(((...)))....))))))))..))))....((....))(((((.((((........)))))))))..((((..((((((.((((((.(((.(((((((((((.((((......(((((..............(((((..((((.......))).)..)))))........))))).............((((....((((..((((.(.......).))))..))))....))))...((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((....((((((....))))))))))))))))........)))).)))))))....(((((..(((((((((.....))))))........)))..)))))....)))))).)))))).....))))))))......))))..)))))).(((((((.(((......))).).))))))...........(((((...((((((.(((.(((((.((...)).))))).))((((((..(((....)))..))))))).))))))))))).................)))))))((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))(((((((((.((.((((..((((((.....))).))).(((((((((((.(((((((((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).))).)))))))))))....(((((((((..(((..(((((..(((((......)))))((((((((((.((..........((.(.(((....)))).))(((((.((((.(((..((((((((((.((......(((((((((((((..(((((((..((((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).))))........................(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).))))))))))).)))))...))..))))((((........)))).........))))))))))).))))))))))..))).)))).)))))...(((((((((....))))...)))))....((((....((((((((.(((....)))...))).........)))))....((((.(((((....))))))))).........)))).)).))))))))))............(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..)))).....................))))).)))..)))))))))....(((((((.(((...)))))))))))))).)).))))))))).......((.........))..............(((((.(((..(((.((.............)).))).))).)))))...)).))))))).)).)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,{,..,..,,||,|||{(({{((,,,,.}||||||.,||||,||{..,{{{(((((((((({((((.{((({{{.....{((((((...))))))}....((((((..,,,,,}}}}|((((,,,((((,.(((({(({,(({{.(((,,,,|}}.}|||.,,,{..{{|,,,,))....})))))))..||||....{,..,.}}((((,,((((........)))))))))..{{{{,,((((((.{(({{{.{((.((((({{((((,((({{{,,..{{{{{..............(((((..((((.......))).)..)))))........||}},.....,,......((((,,.,(({{..(((({(,,,...,|,||}}..})))..,.})}}...((.(((((((((..,{((,....,}}..,.||............((.({..(((((.(((({,..{{..{{((|...})}}}...,}...))))))))))..}).)).))))))))).,}{{{....)))(((,...{(((((....))))))))),)))})}........)))).))))))),|.,{{{{{..{{{{(((((.....)))))}....,..,)}}..))))),.,.}}}))}.)}}))).....,..}}}}}......)}}},,}}}}}},{{{{(({,{{,......}}|,|.}}}}},..}..,...,))))},.,,|((((((((({{{(((,((...}}.}}}},.}}((((((..(((....)))..)))))),.((((((({,({.......(((((.......))))).}....}}.))),))))).},...)))})),,,,.,,.})))))))))).)))))),}.}}}}.{{{,,,.,.)))|{||||||||{{.{{{{||||{{(((((((|(||.|{,,..},||||||{.||||||..(((((...))))}..||,.((((...((({{..((((...)))}.})}}).....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....,,...,,|,|,.{{{{{.,{{{((({{{......}}}}||...,||||,...,.|||,{{{({..,.,))}}}.}},.}}}}}})}}}}}))).)))))))){|{{,{{.{((((...,,{{,{{{,.{{|||||.,.....,((,({{,,,.,,||}}|,{|||||,}.||}|,,,,....,))))}),..(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).)}}.}}}|||}||||,((({...(((,..||}...}}}}...,{|||,,,...})))))))))))))}}.,,})),....{(({({(((({{,((..((((.,,....||))))..)))))))(((((.((....)).))))){(((({.((.(......}.))..|))))},,,{,,....|,,{,{(((((((,..,|,.}}||||,},,|||}}}},|||||((({,.{(((((((({((.........{|||{||.((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))})))))))),,{(((..,,{.,.,||,..,,}||{||{{,.,|||||,,....||,|,,,))}}})}))|.|}||||{||.{{|||||,,|,|{|||{.{{|}|,,,..),))}.)}})).,}}...))))}}}...(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))(({{,{{.....,)},)),{((((((..(((((.(((((.(((({..,..(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).))))){{.({,,......)).)).....((((.(((((....))))))))),{{{.{......,,))}},...(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........,(((,.((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......,.,.}))).))))).)))))))))))}..................,||,|{,}}},)),}}}},))}))))}}}))))}))))})}..))))))}..},,},)))))))})))))))))
Forensic Context

No forensic context available.