Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0020100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104920 hsa_circCHD2_029 hsa-RP11-437B10_0014
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93486073-93489446 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92942843-92946216 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-127.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -136.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((.(((....))).)))).......(((...)))....)))))))(..((((........))))(((((.((((........)))))))))..((((..((((((.((((((.(((.(((((((((((.((((......(((((..............(((((..((((.......))).)..)))))........))))).............((((....((((..((((.(.......).))))..))))....))))...((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((....((((((....))))))))))))))))........)))).)))))))....(((((..(((((((((.....))))))........)))..)))))....)))))).)))))).....))))..................)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((.(((....))).})))....,..(({...}))....)))))))(..((((........))))((((,,((((........)))))))))..{{{{.{(((((.((((,...(((.(((((((((((.((((,,....{{{||....,.........(((((..((((.......))).)..)))))........||}},.....}}......{(((.{..((((..((((,{.......).))))..))))..}.)))}...((.(((((((((...{((,....,}}..,.||............((.((..(((((.(((((,..{{..(((({...}))))...,,...))))))))))..)).)).))))))))).})(((....)))(((,...{(((((....)))))))))}))))))........)))).))))))))))).|}})))}}||(((((.....))))),..{((((({,,..,.{(((......)))},..|||.................}}}})))))})
Forensic Context

No forensic context available.