Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0025200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104924 hsa_circCHD2_035 hsa-CHD2_0124
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
15:93489478-93492306 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92946248-92949076 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1066.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1117.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...........)(.......((((.((..(((....)))((((((((((.((((..((((..(((..(((((((.((((........)))))))))))....)))..)))).((((((.((.((((.(((((....)))))..)))).))...))))))......((((((((((((....(((((((((.....((((((....((((((....))))))..)))))).....)))))))))....((((.(((((((((.((((((.(((.(((((((((((((((((((((.((((.(((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(.(.(((((((((((.((((..(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((...(((((((((((...(((((..(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((.((......)))))...........((((.((((.......)))))))).(((((.(((.(((((........))))).))).)))))..(((((...((((((((.....((((((.((((.(((...(((.((.(((((((((((..............)))))))))))..)).)))....((((..((((.(((((.(((((...))))).))))).))))..)))).))).)))).))))))((((((((((.......)).))))))))((((((....))))))..(((((((((((......((..(((((......)))))..))........(((((((....)))))))((((((((...(((((.((((((((((..((((((((.((((..(.(.((..((((((.....(((((......).)))).........)))))).)).))..)))).))))))))))))))(((.((.((.(((((((....))))))).))..))))).))))))))))))))))).(((......)))......)))))))))))........))))))))..)))))....(((((...))))).((((((.......))))))((..((((...))))..))..........((((((........)))))).((((((((((((((((...(.((((((((.............((((((((.(((.(.((((.((((......)))))))).)....((((((((.(((((...((..((.((((..(((((((.(...((((.(((((((((((((....)))))....)))))..)))...(((((....((((((.((((((...(((((.....((((((((((....((((((((.(((.((((.(((((((....((((......(((((((((((..((((.((((((((((((..(((.(((.(.((((......)))).).))).)))....))))))).)))))))))..)))))))....))))....)))).....)))).)))..((((((....)))))).....(((.(..((..(((((....)))))..))..).)))((((((((...........)))))))).))))))).)))))(((((.(((......))).))))).))).....)))))))))).......)))))..))))))(((((((.((((((......))).))).)))))))(((((((((((((((((((.((((((....(((((..........((((...((((....((((((((..((((((.(((........)))))))))(.(((((.......((((((((((((......)))))))))))).......))))).).......)))))...)))..))))...)))))))))......))))))..))).))).))))..)))))).)))......))))))))))).((((..(((..((.(((((.....(((((.(((((........)))))))))).....)))))))...)))))))...............)))).).)))))))..)))).))))))))).))))))))((..((((...((((..((..(((((...)))))..))...))))..))))..))(((((........))))).......))).)))))))))))))))).)..)))))))))............))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))..))))).)))))))))))...))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..))...))))))))).).).)))))))....))))))))).)))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))).))))))).)))))))).))))))).))))))))))))))))))))).))).)))))).))))))))).)))).(((.((((......)))).)))......)))))))))))).((((..((......))..)))).))))....))))))))))....((((((.........))))))(((((((.(((......))).).)))))).........(((.(.......).))).((.(((((.((...)).))))).))((((((..(((....)))..)))))))).))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.........{(.......,,.|,||..(((....)))((((((((((.,{,{..{(((.,(({..(({{{{{.{{{(.......|}}}|}}}}}}}....|,}..}|}}.((((((.((.((((.(((((....)))))..)))).))...})))))..,..{((((((((((({..,.(((((((({,,,..((((((....((((({....))))))..))))))..,,})))))))))....{{{{.(((((((((.((((((.(((.(((((((((((((((((((((.((((.({(((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(.(.(((((((((((.((((..(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.,.(((((((((((...(((((..(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((.,,,{((.....,||||{{,......}..(((,,((((.....}.)))))))).(((((.(((.(((((........))))).))).)))))..{((({...((((((((.....((((((.((((.(((..,(((.((.(((((((((((..............)))))))))))..)).))),...((((..((((.(((((.(((((...))))).))))).))))..)))).))).)))).))))))((((((((((.......))}})))))))((((((....))))))..(((((((((((......(,..(((((......)))))..}}{|||.{..(((((((....})))))),,|,,||||..{{{,({{{{{...,{{|{{{|{,,,,}||{{..,.|||||,||||{,..,(((((({{(,.,({(({{(((.{,....|{|||{({{.{{{.|,,..,,},}.))))))),.}}}||.{{.(((((((....))))))).})..})))}.}}},.,}.})))))))),)))),,,}}))},..,..))))))))))},,....,,))))))))..}))}},...{({{....})))).((((((.......))))))((..((((...))))..))..........((((((........)))))).((((((((((((((((...{.(((((((((((((((((...(((.((.(((((..(((..(((((..((((((((((((,,{,,{((((,,,(({(((,,,..,|||||}|||||,.((((({{(.(((((((((,((((({{(((....}})))....))))).,((((..,((.((.....(((((..........}}))}.....}}.)),,.)))).(((((.(((.((((.((((((((((.,,.((((......(((((((((((,.(({{{((((((((((((..{{(,(((,,.((((......)))).,.}}),))),...))))))).))))))))),})),))))....))))..,.)))).,,..)))).,{,..,(((((....)))))|||..{((({,..((..(((((....)))))..)}..,.,)))||{{{{{..,,.......))}))))},})))))).))).,|.|.))).))))).........))))))))}.})),,,))))),.,,....,,{(({(((((....})))).}))},...,,,,,,,,...,,,,,,|(((((((({{{,....,,,,||||({....}}}},}},...,{{((((.....))))}||..,,{{{||.((((((.(((........)))))))))|}|||||,,}}}}}((((((((((((,....,)))))))))))).......|||||.|,.....{(((({{...{{((({,,.,||,.,,,))}.))}}}}))))))).,,,)))))),}}))})))))))))))).)))))..)))))))).}}.)))..))))))))}....(((((.(((((........}))))))))}.....,|,,,||{,{{{{({((...............{{{.{{{{{,,|{{{.|(({...}))))))}.))))),)}}....,))},||||,.|{..,,,{,..,}}})).,},.,,,,}}..((((..(((((((........))))))})..)))),...,}}}}))))))))).}..)))))))))............))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))..))))).))))))))))).,.))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..))...))))))))).).).))))))}...,))))))))).)))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))).))))))).))))))))}.)})))).))))))))))))))))))))).))).)))))).))))))))).}}},.{{{.{{((..,...}}}}.}}},...,.)))))))))))),((({,,{{......}}..)))).}}}}..,.))))))))))....((((({.{{.....|}))))){{{{((|,{{,......}}},|.})}}}}......,..||({({,...{{|{||}.((.{((((.((...)).))))}.))((((((..(((....)))..))))))}.,)))),,}}}.}
Forensic Context

No forensic context available.