Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0028300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104927 hsa_circCHD2_043 hsa-CHD2_0033
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93496587-93518180 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92953357-92974950 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-292.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -310.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......((.(..((((.(((.((...)).)))..)))).).))..)(((((((.((((.............(((((((((.....(((......))).(((((((((((.(((((((((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).))).)))))))))))........(((((.((.(((.......(((((......))))).....))).))..))))).....((.(.(((....)))).))........))))))))).((((.(((((.((....)).)))))..))))...(((((..((((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).))))........................(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).))))))))))).))))).)))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......{((((..((((.(((.((...}).)))..))))..{{{{{{((((((({((((.,,.{{{{{{...,((((,,,,.,,},(((......))),(((((((((((.(((((((((((((((((((,,.((....)}{((({((.{{{{{,..{({((,,.||||}..||}.((((...((({{.,((((,,.})}}.}}}}}.....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....{,.....}}}..|||||.,{||((((({......))))|)....||||}..,,.|||,{{|||,.,,,))}}}.,,,.))))))))}}))))).))))))))((((.((.(((((.,,{{{{{,,,.,,.)}}}},}.....{{{.(((......)))))).))))))}.)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).))).))))))))))).((((,..,((((.{,{{..{{{{...,})),.}}.,}))),}}..}}}}}.))))))........)))}))((({{,{{..{{{{.,,....}})))),,)}}|||}(((((.((....)).))))){{|||{.{{,(,,,...|,||,,|||}|}{(((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((.....,,,,,((.{{{.........))),)).((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).))).,..)))))||,|||,........................|{|||,|||||}}|}}}},{......(({....))).......,))}))||{||,|,|{..,,,.)),)))))),..
Forensic Context

No forensic context available.