Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0050904 hsa_circACTN4_009
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:39195574-39205201 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38704934-38714561 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-156.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -167.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(((((.(((..(((((..(((((..(((...((((((..........)))))).)))))))).)))))..)))...((((((((.((((..((.((((((.(((((((....))))))).))..))))(((......)))))..)).))....(((((((....).)))))))).))))))((((((..((((((((......((((....((..((((..((......))..))))..))...((((....))))...............(((........)))((((......)))).........(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).)))....))))...))))).)))..))))))......))))))).))..)))))((....(((((((((((..(((..((.........))..)))..)))...........))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({(((.(((((.,,{..(((({..({{{{|..{{,,,|(((((,,,.,,{,,.|||}}}.|,||||||,}}}})||,}}|,.|,|,||||.,}}},})}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,,,...,,,,,..}}}}}....((((((,....}.))))))}}})))}},((((((..((((((((......((({..,.{{..((((..{{......,,..))))..}|.,((,,,..,.}|||.......}},.....(((........))){(((......)))}.........(((.((((((((((.(((.{{((((.....,|{{{{(,,,...}}....))))...))),))).)))))))))).)))....))))...))))).)))..))))))......)))))))}.}..)))))((..,,(((({({({((..{{{.,|{..,.,,,,,))..}}}..}}}........,.,)))))})}))
Forensic Context

No forensic context available.