Basic Information
Symbol
hsa_CHD2_0032800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104930
hsa_circCHD2_049
hsa-CHD2_0037
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93510555-93528903
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92967325-92985673
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-423.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-447.47 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
225.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((((.((((((((((....((.((((................))))))..)))))))))).))))))....))))((((....((((((((.(((...........(((....)))(((((......((((((((.((((((.(((((.((....)).)))))((((((.((.(......).))..))))))...))))))....(((....)))....(((...(((((((((..((((((((((((((.((((((((((((.........(((((((.((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))..((((..(((....)))..))))((((((...(((((.(((.(((.(........).))).)))((((((.(((((((..((((((((.(((.(.....).))).))))).)))...)))))))...(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).)))))(((..((......))))).(((((((..(((((.(((((.((((...((.(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))((.((........)).)).....((((.(((((....)))))))))..(((((........)))))..(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........((((..((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......))..)))).))))).))))))))))))..................(((.((.....)).)))..))))))....)))))))))))...))))))).......)))))))))))))))))(((((.......)))))...............))))))))).....(((((....)))))(((((((....)))))))..................(((((........(((..(....)..)))........))))).)))))))))...)))...))))))))....((((((((.....((.(((.....))).)))))))))).....(((.((((.((..((((((((.(((.(((((..........))))).).)).........((....))))))))))..))...)).)).)))))))))))))).)))))((((((.(((...)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..((((((.((((((((((..,.((.((((................)))))).,)))))))))).))))))....))))((((..{((((((.{..,((......}}).})))))}..,{(((((......((((((((.{{((((.(((((.((....)).))))){(((({.((.{......}.))..|})))}...)))})}....(((....)))....(((...(((((((((,.((((((((((((((.((((((((((((.........(((((({.((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))..,(((..{{,....})),.}}||((((((,..{((((((,..,,,.,...,},,,}.|||.||{((((((.(((((((..(({(((((.(((.(.....).))).))))).}))...)))))))...(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))(({{,{(.....,)}})).{((((((..(((((.(((((.(((({..,..(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).))))){{.({,,......)).)).....((((.(((((....))))))))),{{{.{......,,))}},...(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........,(((,.((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......,.,.}))).))))).)))))))))))}..................,||,{(.....}).,,,..}}))))),,,))))))))))),..))))))).......))))))))))))}))))(((((......,)))))...............,}}|||}}}....|.(((({...,,,,{(((((((....)))))))).................}},}}}}}.}...{{{..|....},.))).,,.....,,,...)))))))))...)))...))))))))....((((((((.....((.(((.....))).)))))))))).....(((.((((.((,.((((((((,(((.(((((..........))))).}.}}.........((....))))))))))..))...)).)).))))))))),||||.,))}}((((((.(((...)))))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.