Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0047800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0037002 hsa_circCHD2_068 hsa-CHD2_0085
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93543742-93558139 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:93000512-93014909 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-202.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -219.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...............(((((.(((((.....(.....)....)))))))))).....(((((.((((((......))))))))))).(((..(((.....(((.((....)).)))...........)))..)))((((......))))................................((((....(((.....(((((((((((((((............(((((((.((..........(((....)))......((((.((((..(((((((...))))...)))..)).........))..))))....((((((..........))))))......)))))))))..(((((.(..((((((((.......((((...((((..(((((((...(((.(....((.((.(..((((.......((((......(((((...............)))))....)))).......)).))..).)).))....)))).))))))).((((((((((((..(((((((.(((((...((((..((..((...((((.(((((((((.(((((((((((((...)).))))).)))))))))))....((((((.(((.........)))))))))......))))))))))..))..))))(((........)))..................((((.((.(((..........))))).))))..)))))))).))))....))))...)))))))).)))).))))))).)))))..)...))))).))).))))..)))))))))))..))))..))))(..((..(((.(((....)))...(((.......)))..........(((....))).))).))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({...............(((((.(((((.....{.....)....)))))))))).....(((((.((((((......))))))))))).,,{.{(({.....{((.((....)}.))}....}},,.,.|||,{{|(((({......)))}................................((((..,.{({.....((((((((|((({((............((((((,,((..........(((....))}......,,,..{{{......{|||...}}},..,|||.{{{...,{{...,,,,}}}},,,,((((((..........)))))}......)))))))))..{({{(,(,,((((({({.,,..,,({{{...{{{{..{((((((...{{..,....,{.((((.(((.{{....{{(,..{{{......}},.....}}}..,,.))),)))}.},},}.....|,,((((.......))))..}))}.))))))}.((((((((((((..(((((((.(((((...((((..((...,...((((.{(((((({(,(({(({{{(({{{..,||,}}}}}.,}))))}})}}.,,,|,||||||||,,.....,,)}}},}))}......}))))))}....},..}}}|(((........))),..,..............(({(.{{.{{{..........)))}},))))..)))))))).))))....))))...)))))))).)))).))))))).))))}..}...)))),.))).}))),,))))))))))),.))))..})))(..,,..((({(((....)),...{,,.......,}}..........{,,...,})}.,},,))}})
Forensic Context

No forensic context available.