Basic Information
Symbol
hsa_CHD2_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0056
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93443556-93485185
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92900326-92941955
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-372.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-398.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
483.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.(((((((((..(((..(((((..(((((((.....))).)))).)))))..))).....))))).)))..).)).))((((.........((....)).((((((((.......)))))))).(((((((((.(((((....))))).....(((((((...((((((((((((.(((((....)))))..)))).((((.((((((((((((((.((((.(..(((......)))..))))))))))))))))....))).))))((((((..........)))))))))))))).)))))))....(((...((((((((((((.(((((....(((((((((((((((..(((((((.(((.((((((((((......(((((((((((((((((..(((..(..(((((((((.(((((........((((((((.((((..((((.(((((....(((((...))))).....)))))..))))..))))....((((....))))...............)))))))).((((..((((((((((...(((((....((((...........((((.....((....))......))))(((....)))...(((((...(((((((((..((((((...))))))((((.(((((..((.(((((((.(........(..(((.....)))..)...).))).)))).))))))))))).((..((((....((((((.(((......((((((((.((.....))..))))))))...............))).))))))....))))..))...(((......)))........))))).))))....)))))...........((((((.((...)).))))))((((...))))..............))))..)))))))))))))))..))))........((((((.......))).))).))))).))))).))))..)..))))))))))..))))))))))......))))))))))..)))...........(((..((.(......).)).)))..................((((.........(((((((((((((...(((......(((.((((....))))((.((....)).)).......)))......)))...))))))))..).)))).........(((((..((.((....)).))..))))).......))))......(((((((.(((((..........))))).)))))))((((.((....))))))..)))))))..)))))...)))))..)))))..))))).))))))........)))))).))).......)))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(({({{((((((..,((..(((((..(((((((...,,)}),)))}.)))))..)))}},,,}}))),))||.|.,,.||(((({...,,,..((....)).((((((((.......)))))))),(({((((((.{{{({.,,||}|||,,...{((((((...((((((((((((.(((((....}))))..)))},{(((.(({((((((((((((((({,(..(((......)))..))))))))))))))))..,,}}),}}}}((((((..........))))))}))))))).))))))},,,,|{({{{(({(((((((((.((({{....{((((((((((((((..(((((({.(((.((((((((((......(((((((((((((((({..(((..{.{(((((((((.(((((.....,((((({((({,({(({{((({,{{,{{,.,.|(((({{{{|{|{{..,.||||,,.||||{{|,|,....((((....))))...............,,}}||||{((((,.((((({({(({..,,{{{....||||.},,,......((.{....,}}..|.}|}}|...(((((((...,.{{..{((.,,{{{((.,|,{(({{{{{{{{..,}}||})|||,.||||}..||}.,,.}},},..}})}}}}.}|||,.}}})))}.,..})}}})}||||,||}}}}},,,|.||.,||{{{.,((({((.,|,{||||{.((((((((.({.....}}..))))))))...,,,,.,||.,|||||,,|||.||,..,,,,...,..}||})}..}.,)),..}},..}|}|||.|.,,|||}||,}||||.,,...}||{(((.||....).)))))}{(({...})))...|.,,.......}}}},|}}}}}}}}}}}}}}}.,)))),..,..,}||}|||}...,}.))),)))}})))},)))))}})))}.)..)))}))))))..))))))))))......))))))))))..))).,|,||.....(((..({.(......}.)}.})}....,........}}...|||{......,}|||{,.{(((((({...(((......{((.,{{{.....}|}((.({....}}.)).,.,...)))......)))...}))))))),,|||}}|,.......,(((((..((.({....)).))..)))))}.....,}})}......(((((((.(((((..........))))).)))))))|||,|||,}}}))))},..))))))).})))))|||}},,,..))))}..}}|||,}}}})),,,,,...}|||||,.,,...}}}})))))))))...))))
Forensic Context
No forensic context available.