Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0005000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0050909 hsa_circACTN4_014
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:39200035-39212518 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38709395-38721878 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-377.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -393.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((...))).....)((((....(((((((((((.(((((((......)))).........(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).))).....))).)))).)))).)))...(((((...(((((((((.((((.(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............((((.(((((...((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((((((...((((((...(((((..(...((((((((.((......))))))...))))..)..))))).))))))((((.....)))).....))))))......((((.....))))..((((...(((.((.((((((...)))))).)).))).)))).(((.....))))))))))))..((((.((((((((.(((((.((.(.....(((..(((.(((((((..((((((((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))...))).)))...((.....(((((((((..(((...........))).....)).)))).))).....))))))))))))..)))))).)))))..((((..(((((((((...(((.(....).))).))))......((....))))))).))))......(((.((((.((((............)))))))).)))..)))))))))))).))))))))))))))).)))(((((((..(((.......(((((((((..((((...((((......)))).))))..))))))..))).)))..)))))))((((((((.(((.....))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..({{...}}}.....)((((,,..{((((((((({.((({(((......)))}.........(((.((((((((((.(((.{{({((.....,{{({{(.,....}}....))))...))),))).)))))))))).))).....))).}))).)))).)))...((({{...((((((((,,((((.(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............(((,{(((((...((((((((.,(,.,..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).......,),.)))))))).((((((...{(((((...,{((({{(,,((,,,((((.({......))))))..,)}))|.),,},,,|.)))))|((((.....)))).....))))))......{|((,....}}))..((((...(((.((.((((((...)))))).)).))).)))).,,,......},)))))))))..{(((.((((((((.,..(((((.(,.(({((((({((,{,.,,,{.{((({,.((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......))))))|{{.||..|||...|,.,|}}.{{(,,..}|,,|{||.||..,,|.||||||.....|||,...||..||}||||.,|||...|,..}}))})))}},{.{{|,{{{{|||||.,.||}}|.,}}})))),,)}}.},)).}))}}}.)),.),,))))......(((.((((.((((............)))))))).)))..)))))))))))).)))))))))))))}}.)))(((((((..{{,,|||...{({((((((..((((...((((......)))).))))..))))))..))),})}..))))))}{{{(((((.(((.....))))))))))).))))
Forensic Context

No forensic context available.