Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0004800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0164
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107567652-107568125 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104805371-104805844 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-143.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((......((((.(((.((((..((((.(((((((.((((.((....))..))).).)))))))..)))).))))))).)))).......)).)).)))))((...((((((.(((...(((((((......)))))))(((((((((((........((((((((.........)).)).))))......))))).)))))).(((((((((((((.......))))).)))...)))))))).))))))((((((.(((...((((...(((((.((((((.........)))))))))))........((((((((((.....))))))))))(((.(((......))).)))(((((.......)))))))))..)))))))))..((((.(((.(((......((((...((((((((........)))))).))))))........))).))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.{{{{.,,,|,((((.(((,{(((,.{(({.(((((((,{(((.{{....))..})).,.)))))))..})}||||}||||,,||}.,,....,),)}|))}))((.,,{{{{{(.{({...(((((((......))))))){(({({((((,,{,.....(((((,,,.......}}))})).))))...}|,})))}.})))))}}|{{{{{{{{{{{.......))))),)))},,|}|..}}}.})))))((((((.(((.,.((((...(((((.((((((.........)))))))))))......,,((((((((((,...,))))))))))||{,(((.,,,,.|||.}}}|{{{|,,.,,},}))))))))..)))))))))..((((.(((.(((......((((...((((((((........)))))).)))))).,......})).))).)))),)
Forensic Context

No forensic context available.