Basic Information
Symbol
hsa_CHD2_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0157
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93444397-93496803
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92901167-92953573
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-450.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-483.78 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
346.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..((((((.((((..((((((.......((((..(((((((..((((((((((...(((((....((((...........((((.....((....))......))))(((....)))...(((((...(((((((((..((((((...))))))((((.(((((..((.(((((((.(........(..(((.....)))..)...).))).)))).))))))))))).((..((((....((((((.(((......((((((((.((.....))..))))))))...............))).))))))....))))..))...(((......)))........))))).))))....)))))...........((((((.((...)).))))))((((...))))..............))))..)))))))))))))))..))))........))))))).....((((.......((((((.(((((...(((((((...............(((((.((((.....(((.....)))..(((((((..(((((((......((((((((....((........))...((((((.(((((((((((((((((((...(((......(((.((((....))))((.((....)).)).......)))......)))...))))))))..).))))..(((((((..(((((.((......(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))).(((((..((((....(((((..((.((.....((((.....))))....(((((((...)))))))....((((((..((((.....((((....((((..((((((((.((((.(((....))).)))).......(((...)))....))))))))..))))....((....))(((((.((((........)))))))))..((((..((((((.((((((.(((.(((((((((((.((((......(((((..............(((((..((((.......))).)..)))))........))))).............((((....((((..((((.(.......).))))..))))....))))...((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((....((((((....))))))))))))))))........)))).)))))))....(((((..(((((((((.....))))))........)))..)))))....)))))).)))))).....))))))))......))))..)))))).(((((((.(((......))).).))))))..........)).))))))).....))))..))))))).)))))..)))))))......))))))...)))))).)))))))))))))))...........)))..))))....(((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).........))))))))).......))))))).))))).).))))).......))))..........(((..(((......))).))))))))).)))).)).))))..))).)((((...(((((..((((...)))).))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((..((((((.({((,.((((({,,.....{{{{,,{,,((((..((((((((((...(((((....({((.,.........((.{....,||..{,{{,,{{,.||||(((....,}}..||{,,||||{{,{||{{|||||{,,,..{||||||((((.(((({..((.{{{{{|{.{....||,,{.,(({.,{{.|||,.....),))),)|||.||}}}}}}}}}.||.,||((,,.{(({{{,,||{||||{.((((((((.((.....))..))))))))...,,,,..|,.,|||||,,|||.|{...||||......,||))}..,.,)),..}},..)))))|,|,|.|||))),}|||,......,|||(((.||...,).)))))){,{|,..,))),,,}..........))))..)))))))))))))))..))))......|.||||}}|,,,,.((((.......((((((.(((((...(((((((...............((({{{((((.....(((.....})}..{{{{.....(((((((......((((((((....{(........))...((((((.(((((((((({((((((((...(((......(((.,,{,.....||,((.({....)).)).,.....)))......)))...))))))))..).)))),.(((((((..(((((.(((.....(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))){{{((((.,,,|}}}}}....((((..((((..(((((((..........{((((((...))))))}....{(((((......}))))),,,....((((..((((((((.((((.(((....))).))))....,..(((...)))..,.))))))))..))))..,,{{....,,((((,,((((........))))))))).,|||,.{(((((.((((....(((.(((((((((((.((((.,....{{{{|....,.........(((((..((((.......))).)..)))))........||}},.....,}......{(((.{..((((..((((,{.......).))))..))))..}.)))}...((.(((((((((...{((,....}}}....||............((.((..(((((.(((((...{{..(((({...}))))...,,...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((,...{(((((....)))))))))}))))))........)))).))))))))))).,))))))},|(((((.....))))),.....)))))))..))))..)))).{,.....,}.......,.((((..(..(({.(((({,((,..(((((((.(({......})).).))))))..}......))))))).)))..)..)))),....,))).)))))..))))))).,....))))))...)))))).)))))))))))))))...........|||...,,,}}},{((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).........))))))))).......))))))).))))).))))))).......))))....,,.,,}|{{.{({{..,,..))).}.))))))).)))}.)).))))..))).)((((...(((((..((((...)))).))))).....))))
Forensic Context
No forensic context available.