Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0006400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0278
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93444397-93515157 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92901167-92971927 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-626.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -672.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.