Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0006500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0229
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93444397-93521613 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92901167-92978383 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-756.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -808.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((....))))......(((((......(((((((((((((.((((.(((((..........))))).))))......((((.....((....))......))))(((....)))...(((((...(((((((((..((((((...))))))((((.(((((..((.(((((((.(........(..(((.....)))..)...).))).)))).))))))))))).((..((((....((((((.(((......((((((((.((.....))..))))))))...............))).))))))....))))..))...(((......)))........))))).))))....))))))))).......((((((.((...)).))))))((((...))))..((((.((((..(((((((((.....(((((((((((..((.....))((((((...((((((((((....((((((.(((((...(((((((...............(((((.((((.....(((.....)))..(((((((..(((((((......((((((((....((........))...((((((.(((((((((((((((((((...(((......(((.((((....))))((.((....)).)).......)))......)))...))))))))..).))))..(((((((..(((((.((......(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))).(((((..((((....(((((..((.((.....((((.....))))....(((((((...)))))))....((((((..((((.....((((....((((..((((((((.((((.(((....))).)))).......(((...)))....))))))))..))))....((....))(((((.((((........)))))))))..((((..((((((.((((((.(((.(((((((((((.((((......(((((..............(((((..((((.......))).)..)))))........))))).............((((....((((..((((.(.......).))))..))))....))))...((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((....((((((....))))))))))))))))........)))).)))))))....(((((..(((((((((.....))))))........)))..)))))....)))))).)))))).....))))))))......))))..)))))).(((((((.(((......))).).))))))..........)).))))))).....))))..))))))).)))))..)))))))......))))))...)))))).)))))))))))))))...........)))..))))....(((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).........))))))))).......))))))).))))).).)))))..(((((((.((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))))((....)).........)))))))..............(((.(((......)))))).........))))))).)))....)))))).(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).((((.(.(((.((((((((....((((.(((.............)))))))....)))))))).))).).).))).....((((((((((((.((..((((.........))))..)))))))(((((.((....)).)))))((((((.((.(......).))..)))))).............(.((((((((...))..)))))).)..)))))))..))))))))))))))))))))..)).......))))))..((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......)))))))))...)))))..(((((....(((((((..((((((((.(((.(.....).))).))))).)))...))))))).....(((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).)))(((((.(((...(((((..((((....)))))))))....(((.(((.....(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))))).)))..))).)))))...)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((....))))...,,.,((({..,.,.(((((((((({(((((((.{,(((....{{{....}}),.),}}...}},||,,.....{{....||.,,...|}}}(((....}))...(((((...(((((((((,{((({{{..{||||||({{{.{{(({.,((.,{{{|||,{,...||}||.,(({.,{{.|||{.....)}))),)|||.||,,|},,,,}.||.}||((,,.{{{{||,}|||}}}},.((((((((.{{.....))..))))))))...,},}.}}}.}||}|)}},}},}|...||||...,...|||}}....,))...}),..))))).))))....))))))}},.......((((((.({...,).))))))((((...))))..((({,((((..(((((((({....,(((((((((({..((.....))((((((..,({((((((((....((((((.(((((...(((((((...............((({{{((((.....(((.....})}..{{{{.....(((((((......((((((((....{(........))...((((((.(((((((((({((((((((...(((......(((.,,{,.....||,((.({....)).)).,.....)))......)))...))))))))..).)))),.(((((((..(((((.(((.....(((.(.(((......)))).)))......(((((((.(((((..........))))).))))))){{{((((.,,,|}}}}}....((((..((((..(((((((..........{((((((...))))))}....{(((((......}))))),,,....((((..((((((((.((((.(((....))).))))....,..(((...)))..,.))))))))..))))..,,{{....,,((((,,((((........))))))))).,|||,.{(((((.((((....(((.(((((((((((.((((.,....{{{{|....,.........(((((..((((.......))).)..)))))........||}},.....,}......{(((.{..((((..((((,{.......).))))..))))..}.)))}...((.(((((((((...{((,....}}}....||............((.((..(((((.(((((...{{..(((({...}))))...,,...))))))))))..)).)).))))))))).))(((....)))(((,...{(((((....)))))))))}))))))........)))).))))))))))).,))))))},|(((((.....))))),.....)))))))..))))..)))).{,.....,}.......,.((((..(..(({.(((({,((,..(((((((.(({......})).).))))))..}......))))))).)))..)..)))),....,))).)))))..))))))).,....))))))...)))))).)))))))))))))))...........|||...,,,}}},{((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).........))))))))).......))))))).))))).)))))))..{{{{({{.((((((((((((,,.((....)}{((({((.{{{{{,..{({((,,.||||}..||}.((((...((({{.,((((,,.})}}.}}}}}.....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....{,.....}}}..|||||.,{||((((({......))))|)...,||||}...,.|||,{{|||,.,,,))}}}.,,,.))))))))})))))).)))))))))),,....||||,......}}}}}}}.,|||,........{{{.(((......))))))...,.....))))))).})).,..)))))).(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).((((.(,(((,(((((({(....((((.(((..,..........)))))))....)))))))),))).}.).))).....(((((((((({{{((..((((.,,....,,))))..)))))))(((((.((....)).)))))((((((.((.(......).))..))))))...,......,..(.(((((({{...}}..)))))).)..)))))))..})))))))))))))))))))..)).......))))))..((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...)))))).....})))))))))..}))|||..,,{{{,.,,{{{{{{|,,{{{(((((,{{{,{.,...}.}}}.}}})}.})}...)))))}}...{{(((.(((((((({.{{{|,,,...|}}}..,))).....})))).)))||(((.{((.,{((,{{.||{||,.|||||,,,}}},},}|(({({{.....(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).)))))}}),)))}.))).))))}...,)}}),,,
Forensic Context

No forensic context available.