Basic Information

Symbol
hsa_FNDC3B_0022300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0068004 hsa_circFNDC3B_054 hsa-FNDC3B_0237
Host gene
FNDC3B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:172025153-172098883 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:172307363-172381093 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-689.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -733.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 612.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((((..(((((.....)))))..((((((.....(((((((((.......(((....)))(((....))).............)))))))))....))))))...............)))).)))...)))))..(((((...(((((.......(((((.(((((..(((((((...(((((((....(((((....)))))...((((((((((..((...)))))))))))).(((((.....)))))..(((.....((.(((((((.(((.(((((((((((.(..((.......))..)))))))..)))))..)))...))))))).)).....)))....)))))))((((((..(((.((((....)))).).))..))))))(((.(((((((.((.(((((((...((((....)))).)))))((((((..(((......))).))))))....(((((.((((((((((((....((((((((............)))))))).(((((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....(((((((((...(((.....)))....)))))((((((((((..(((((((((((((((((........))))...))))))))((((((.((......))...))))))..((((....(((....)))....)))).(((((.(((((((.((((((.((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...((((((((..((((((.((.....)).)))))).(((......))).))))).))).)))))).))))))))))))))))).(((...))).((((((((((.((((((.....))))))....(.((((((....(.(.(((((((((((.((.(((((...(.(((.....))).)(((((((.....))))))).......((.((((((.((((((((...)))))).))...))))))))..(((((((.......((((((((.(((..((((((((.........(((.((((((((...(((((.(((((((.((..(((.......))).)).)))..))))..)))))...)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))))).)))).))))..)))))))..(((.(((((((......)))))))))).....))))).)).).))).)))))))))..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))))).((((((............))))))....)))))).))))(((.......)))...((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...))))(((((((((((..((.....))..))))))).))))((((((....)))))))))))))..((((((((.((..((((((.((.((((...(((((((((.(((((.....(((((...(((((.(.((((((((.((..(((((.(((.((((......)))).))).......((((((.......((((((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....)))))).................))))))...((((.........))))....((((((.((......))))))))....))))))......((......))((((((((((((..((((..(.((((.(((.....(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).)))))))).....))))))).)..))))))))).......)))).)))....(((........)))..)))))...))..))))))))))))))..(((.(((.............))).)))))))).))))).)))).).)))).((((((....)))))).................((((........))))...................)))).))..))))))..)).........((((........)))))))))))).........)).)).))))))))))......))))))).)))))))))).......)))))...)).)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({,,{,,,{{{..,{{((.....|||}|..||{({{,{({{({{{,(({{{,{{{{{,.{,{{,({(,(({{{{((({,,,,,,,{{,,...({{{{,{,.{((((((....)))).))}.,{,||||||||,,,|}|)}..|||,|...|||{{.....{{,(({,{({{{{..,||||||}},|{{{|||....(((((....))))).,.((((((((((..({...)}))))))))))},{(((,,,..}}}})})}}|}))..,|}||{{{||}|||.(((((((((((.(..{(.....,.)}..,)))))),.}))))..}}}}}})))}))},},,,...}},....)))))),((((((..(({.((({....)))).},))..)))))){{{.||{{{{{.{|,{,|||{,,..{(((....)))).,}}}}((((((..{{{......))).))))))...,(((((.{{,,,,,.,,,,....((((((((.,,....,,,.,||}||||}.{{(((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....{((((((({...(((.....)))....))))}(((((((((,.{(((((((((((((((((........))))...))))))),((((((.{(......}}...))))))..((((....(((....)))....)))).,{{((.(((((((.(((((,{((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...{{{(((((..{{{{||,||.,,,,||.||}}}).{{,......,}}.)))))},},.,,}))).)))))))))))))}}}).{{,...}}}.((((((((((,((((((.....)))))),,..{.((((((....,,(.(((((((((({.((.(((((,..,.{{|,,,..|||,|(((((((.....))))))).,.....,{.((((({.((((((((...}))))).))...})))))||,{(({{{{||,.,||.((((((((.{{{..((((((((.........(((.((((((((,,.(((((.(((((((.((..(((.,....,))).)).)))..))))..))))),,.)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....)))))},}}.)))).)))){{|||||})|}|{{,{(((({{.,....))))))}}}}.},..))))).)),,.))).)))))))}},.)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))))|{{((((,...({{,,,...}|,,,.....))}))),)){{(((.......)))}}.((((...{{(.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))})))...)))}(((((((((((..({....,|}..))))}))))))){(((({....))))))))))))}..{(((((((.|{,,((((((.((.((((,{{{((((((((.{((((.....{{{{{...{((((.{.((((((((.{(..(((((.(((.((((......)))).)))....{{,((({{{......,(((((((((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.)))))).................))))))}..,{{{,{,,.....||},.,,.(((((((((......))))))))....,}})},......((......}},,,{((((((((..((((..,.((((.(((.,...(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).))))))))...,,))))))).}..))))))))).,,,...}}}}.})},....,,..,,,...,}}}|)))))...,,..))))))))}))))}.{(((.(((.............))).)))),,}}.))))).)))).).)))).((((((....)))))).,.,..,....,,},,.((((........)))).................,.)))).))..})))))..)}..,{,,.{{{.,|.},,.,,,},,})))))))),,,{.,...,,..,})))}))}}}}.....,)}})))},))))))}))}}}},,,,),,))}}})).,...}})
Forensic Context

No forensic context available.