Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0021100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0175
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93487645-93540633 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92944415-92997403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-813.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -865.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 721.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((..(((.....((((...(((..((....((.((((((.(((((((((...(((.....)))..................((.((..(((((.(((((...((..(((((...)))))...))...))))))))))..)).)).)))))))))...(((....)))(((....((((((....)))))))))((((((((((((((((((((((((((.........)))....(((((.....)))))............(((..(((((((..(((...............((((..(..(((.(((((.(((..(((((((.(((......))).).))))))..)......))))))).)))..)..)))).......((((((((.(((.(((((((((..(((....)))..))))))..........((((.................)))).(((((.((((..((.(((.......))))).)))).)))))((((((((.((((.(((.......((((((((.((((....(((((...((((((...((.(((....((((((((.(((((((.((........(((((((............((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...........((((...))))....((((((......))))))..(((((((.........(((((.....))))).....((((((((((.....((((((.....((((((.((((.....((.((((.(((((((........((((..(((.(((((.(.((((((...((.(((((....))))).))..(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).((((.(.(((.((((((((....((((.(((.............)))))))....)))))))).))).).).)))......(((........)))(((..((((..((((((.((.(.((((.(((((.((....)).)))))..)))).).))......(((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).)))).))..)))................(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).)))))))))))....))))..)))(((((((..(((((.(((((.((((...((.(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))((.((........)).)).....((((.(((((....)))))))))..(((((........)))))..(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........((((..((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......))..)))).))))).))))))))))))........................))))))))))))))).))))))))))).)))).))....)))).))))..(((((.(((...((((..(((((.......)))))..))))...)))))))).(((.....)))(((((....)))))(((((((....)))))))........................(((...((((((((...(((...........)))...))))).)))...)))))...))))))..))))))))))............(((((.......))))))))))))...)))))))..)))))))))..)))).))))...))).))....))))))...)))))))))...((.((((((.(.(((((((((.(...((.((((((.......((((((.(((...)))))))))..)))))).)).).))))........))))).).)))))))).)))))))).((((...))))....(.((..(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......)))))))..)).)...))).))))....))))))))............))))))))))))))(((((.(((((..(((((...(((..........)))...)).)))..))))).))))).))))))))))..))).............((((.((.......)).))))...))))))))..))))).)))....)))))))((((.....))))..))))))))....))..)))..))))......)))..(((((.(((......)))...))))))))))...)))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...((((({{{{{{{...,{((,{,,,,,|||.,,.{{{,.||||,{((((((((,.{((({.....,}..,.{|............{{.{{.,||||{,||||{,..{{..,{{||,..|||||,...,.,.}}||||||}|,,||,||,}}}}))))}.,|(((....|||((({..,((((((....}|||||||}.|{((((({{{{{(((((({((({{({,,.{{,.{|,,,,.{(((((.....)))))}....||.,|.,{{{,||||,|||,.{{{,,..|||........{{{{..,..{{|.((((,,((,..(((((((,{({......}}}.}.)))))}..}......))))))).}}},|}||))))}{((((.((,,,||,}||}|,{{((((((..(((....)))..)))))),.{(((((({,({.......{{({{.......))))},|,...||.)))|))))}.,.,,,))))}..,,,.,,.,,((((((({.((((.(((.......(({{((({.{(((....(((((...((((((...,{.(((....((((((((.(((((((.((....,,..(((((((.|||||..,|,.((((.,.((({,.,(((({{.}}||.|||||.....},},....((((,.,((({....}))))))))....,,.....}}|..}}}}}.,,},||||{{......))))})..{{{{{{{.....{{{.(((((.....))))).,},.((((((((((,,(((((.((((....(((((({((((...,,{{,{{{,,||||}|}.,.....{{{.(((......})}}}},}}}}}...((.(((({....})))).))..(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).{(({.({((({(((((({(....((((.(((..,..........)))))))...,))))))))}})),}.).)))......)))).))....)))))))))......((((((((.{,((((.(((((.((....)).))))){{||||.{{.{......}.}}..|||}}}...}}}}}}.,..(((....)))....(({...((((((((({.(((((((((((({{.((((((((((((.........(((((({.((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))..,(((..{,{....}}},.,}}|((((((,..{(((({{....,|.,...}}}},),}||.|}|((((((.(((((((..{{{(((((.(((.{.....).))).))))).}))...)))))))...(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))(({{,{{.....,)},)),{((((((..(((((.(((((.(((({..,..(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).))))){{.({,,......)).)).....((((.(((((....))))))))),{{{.{......,,))}},...(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........,(((,.((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......,.,.}))).))))).)))))))))))}..................,||,{{.,,,.)).,,},.}})))))}},)))))))))))}..)))))))..,....))))))))))))}}}}}(((((.......)))))............,,.}}}|||}},...,|,((((,...,,,,|(((((((....)))))))}.................}},}}}}}.}...{{(,,{....},,))).,,.....,,,...)))))))))...)))...))))))))..}}}|||||||.....,,.{{{,{,{,|,,.},}})))))),}}))).,,)))))))..)))))))))..)))).))))...))).}}....))))))...)))))))))...,||||||||.{|(({{,(((,((.(.,..|,||||}.}}},.((((((.(((...))))))))),.,||}}},||.,|||||.....}}})))))|},|||||,...,|||||}|.((((...)))).,.,,}||,.(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......)))))))}}))}}...))).))))....})))))))............)))))}))),))))|((,{{(((,{..,,|||}},,||..........))}..,)),))),,})})}.,,||}.}}}}}}}))),.}},.............,{{{.{{.......}),))}),..}})})}))..}}})}.)))){|{||,||((((((.....})),))))).)))))))})},,},}...,,}))}}}})),..|{(((.(({......}))...)))))}))))...)))))(.....)
Forensic Context

No forensic context available.