Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0024900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0268
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93489268-93524687 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92946038-92981457 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-536.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -569.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 469.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((..(((((((...(((....))).((((((((((((((...((((((((.....))))))))((((((.(((((((((.((..((.....((((((.....))))))....)).....)).))))).))))....)).))))........((((..(..(((.(((((.(((..(((((((.(((......))).).))))))..)......))))))).)))..)..)))).(((((.((...)).)))))...((((((..(((....)))..))))))..((((((((.((.......(((((.......)))))......)).))).)))))...((((((.((.......(((((((((((.((.((((..((((((.....))).))).(((((((((((.(((((((((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).))).)))))))))))....(((((((((..(((..(((((..(((((......)))))((((((((((.((..........((.(.(((....)))).))(((((.((((.(((..((((((((((.((......(((((((((((((..(((((((..((((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).))))........................(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).))))))))))).)))))...))..))))((((........)))).........))))))))))).))))))))))..))).)))).)))))...(((((((((....))))...)))))....((((....((((((((.(((....)))...))).........)))))....((((.(((((....))))))))).........)))).)).))))))))))............(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..)))).....................))))).)))..)))))))))....(((((((.(((...)))))))))))))).)).))))))))))).......)).)))..))))))))))))....)))).))))))))....)))..)))..((((.(((....((((.((.....)).)))).....))).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....(((..((((({{...{{(....}}}{,{{,,(((((((((...((((((({.,,,{|||}}}},((((((.(((((((((.{{{{((.....{(((((.....))))))....)).}}..},.))))).))))....)),,)))........{{{{..{..{{{.((((,,((,.,(((((((,{{,......}}},}.)))))}..}......))))))).))).,},}))))}(((((.((...)).)))))...((((((..(((....)))..)))))){.((((((({{({.......{((((.......})))}.},...}}.)))|))))}.,.||||||,|,,,,,.|,(((((((((((.((.((((...,,,....,.,|,|.|||(((((((({{({.((({(({((((((((((((,,.((....)}{((({((.{{{{{,..{({((,,.||||}..||}.((((...((({{.,((((,,.})}}.}}}}|.....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....{,.....}}}..|||||.,{||((((({......))))|)..,,||||}..,,.|||,{{{||,.,,,))}}}.,,,.))))))))}}})))).))))))))||((,((,{((((,{{,.,{,{{{,||{||,,,,,.....{{{.(((......})}}}},}}}}}}}.||}|{{,,....,))))}),..(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).}}}.}}|||||||||,{.{,,,,((((,,{({,..{{{{{...,|||,}},..})))}|||||{{|{|,||||||......|||{|{(({|,.||,,{{{(,{{....||}|||..||}|||}(((((.((....)).))))}(((((..(({({{{..,{{{(({(((.{.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((.....,,,,,((.{{{.........))),)).((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))}.)))}...............,........(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))}))))),)))}).,,)),,}}}}}}|||{,||||||},{((,(({.....(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,{{((...{((((((((....)))),,,)}))),..,},))))).))).)).))))))).)))))))),)}}..}},.,)))).....((((.(((((....))))))))).,,,....,)))),))})))))|||||||{{........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..,,,...,,{........,|||}}|{||,..)))),))))....,{{|||{.{||,,,)))))))}},)))).)).))))))))))).......}}.))).,)))))))))))}....}}}).})))))))....)))..)))..((((.(((....((((.{{.....}).)))).....))).))))..
Forensic Context

No forensic context available.