Basic Information

Symbol
hsa_CAPN12_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0042
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
19:39220522-39220887 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38729882-38730247 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-100.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -107.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((...((((....((((((((.(((.(((..(((((((.((((.((((......(((((.........)))))....)))).)))))))))))................))).)))..))))))))...))))...))).)(...............(((((((...)))))))(((.((((((............(((((.(.((.((...)).)).).)))))...(((((((((.((.(((..(((..(((((((.((((.....((((.(((((((((..((((.....))))..)))))))).).))))..))))))))))).))).))).)).))))))))).))).))).)))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,,(((((....}))}},,.{(({({{.{{{..(((((((.((((.((((......(((((.........)))))....)))).))))))))))),,}}.))))}....,{{.(((((((((,|,{((((({.(((((((..((............)).....))))))).)))))))}..))))))))).}}}|,.,((((({(.((.,,.((((.(,.,.),)))}...,||,)))|}||}{((.,((({{(((((((,((,{....,{|{{,{{((((({|..((((.....))))..)))))))).,.))))..})))))})))},))),|||||||},}}}})))}}||.,,.,},}},}
Forensic Context

No forensic context available.