Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0026600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0169
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:93491977-93494495 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92948747-92951265 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-715.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -765.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 698.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(.(((((...(((.((((((((((((((((((..((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..((((((..(((((.....(((((.((((((((.(((.....))).))).)))))((((((((((((((......((((..(((.((((.((((((((..(((.(((((((.(((......))).).))))))........((.(((((...((((((.(((.(((((.((...)).))))).))((((((..(((....)))..))))))).))))))))))).)).))).)))))))).)))).)))......((((((((((((((.(((........))).))))((((........))))((((((((.((((.............((((((...............(((((((.(.(((((((((..((.((.(((....))))).)).)))))).))).).)))))))...........(((..(((((....)))))..)))..(((((((((.((((((((.(((..((.......(((.(((...))).))).......))..))).))))))))..)))).)))))..((((((((((((((..((((....(((((((((((.((((.......)))).).))))))))))....((((..(((((...........((((((((.......((((.((((((((...........))))...)))).)))).........))))))))...((((......)))))))))...))))....))))))))).........))))))))))))))))))))))))))).....))))))))))(((((((((((((((..(((((((((...)))))))))..)))))))).............(((((((...))))))).)))))))((...(((((((...(((((((((((.(((((((........)))))))..))))))((((((((.(((.........))).))).)))))(((((((.((((...((......))..))))))))).))..........)))))...))))))).))))))........))))))))))))))((((((((((((.((((((((((..(.((((.((.(((((.((((((......((((...))))......(((((....................)))))...(((((.((((.(((((((((((......(((((.........)))))(((((((((.((((((((((......(((.((......)).)))..(((((((....)))))))(((((((............))))))).............((.(((.(((.((((((.(((((((............((((......))))....(((((((...((((((.((((......))))..(((((.....)))))...(((((......))))).....))))))...)))))))......)))))))....(((((((..........)))))))(.((.((((......)))).)).)......((((((((..((((....)))).)))))))).((((((..........)))))))))))).))).)))))..)))))))(((((......))))).))).(((((((......)))))))(.(((((.(((...))).))))))......))))))))).................))))))......)))))..)))).)))))...............)))))))))))..)))))))..)))).........))))))..)))))))((((((((.((..((((((..(((....((((...((.(((((((.((.......))..)))))))..)).))))....))).))))))..))))))))))............))))).................((((((.(((.(((((((((((((....)))....((((((..(((((................))))).))))))(((..((((((...))))))..)))....(((((((((..(((....)))..))))))))).(((((..((((.(((((....((.....))....))))).)))).))))).........)))))))))).))).)).))))((((((((((((((.................)))))))))((((((((((((...............))))))))))))....))))).((((((..(((((((((.(.....).)).))))))).)))))).........))))).))))).....))))))...)))))....)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).))))))))..)))))))))))))))))).)))...))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.............)(.(((({.{.(((.((((((((((((((((((..((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((({,,,,,,,((((((({(.(((,,...(((((.(,{(({{(,((({,{{{|||.,,,.,},,,((((((((((((((....((((,(,{{(((((((,((.....|}}||||{,||{|{||||....,.,||{{.|||,,..,,..,,.((((((.,..{((((({.{((.{((((.((...)).))))}.))((((((..(((....)))..))))))}.})))))),,...)))))).},,,,..,,||||,|,,......((((((((((((((.(((........))).)))){(({.....,,,,{((((((((((.((((....,....,||,(((({,.{((((({{.(((.......)))..}}}}}}))),,{{|{|.{({,.{{{{{{|,||,||||||.,|{{{,,,,,}||{{{{,..{{..(((..(((((....)))))..)))..},.,}||||{{{{{.{{{,|||..{||,,,.}}|{,,,||.}|},}}})),)}|{{{{|.,|,||}....,},,,|)))))}...,.,{{{{{{{{{{{{{,.,|||,...(((((((((((.((((.......)))).).))))))))))...}||||,,|||{|},...,,,,,,((((((((,.,,{..((((.((((({((...........}}},..})))).))))...,,,...))))))))...((((......))))||||}...)}}|{|{,||,.,,}))},,,,....}}}}}}}},})}))))))))))))))))})}.)))))))))){{(((({((((((((..(((((((((...)))))))))..)))))))).............(((((((...})))))).})))))|((.{.(((((((...(((({((((((.(((((((........))))))},.)))))){(((((((.(((|........)))}))).)))))(((((({{(,{{||,|,,.....,)).})))))))).))..........}))))...))))))).))))),}}},},},)))))))))))))){(((.(,(((({..,,,}))))),))})|||,,{{{{......,))),,),))))),,)))))}}))),,|{(((......,.....,......,)}}},...(((((.{((({(((({{{({((,,,...({{{{.........)))))(((((((((.((((((((((.{{,..(((,((...,,.||,|}}..{{(((({....)))}))|(((((((.{,.....,,..)))))))},|,.{{{{{{{.,,.,,,...,}}}|}}}.{((((((............((((......)))),,,.,{{{{||.,.{{(({,..,|(|||...}))},.,((((,,...|||||...}}}}|.{{{{{}}}}).,,..||||||...}}}}}}),,,,..})))))}....{((((((,.,....,,.))))))},.{(.((((......)))).},.,......{(((((({..{(({....|}}},}))))))}.{{{|||,.....,,,.})))))}})),)}))).,})}},.)))))))(((((......))))).))).(((((((......))))))){.(((((.(((...}}}.)))))),.....)))))))))..........,,,,,..}})))),.,},.}}},...)))).))))}.,.{{{{{{{,..,,,,..,{(((((.(((.((({.,|({{{.(((((....))))).}}})}},(((((((((((..((((((..(((,...((((...((.(((((((.((.......))..))))))),,)).))))..,.))).))))))..))))))))))...........((((((.,,....,,,,,,,,..((((((.((,.(((((((((((((,{{,|,,..},||||{|,.{{{{{.,.{{.....,,....))))}.})))}}(((.,((((({.,,|}}}}}..}}},...{{{{{{{{{..(({,..,)))..))))))))}.{((((..((((.(((((....{{.....,}....))))).)))).))))}........,}))))))))).})).)).)))),,,,.{((((((({.,...............))))))))}{(((((((((((...............)))))))))))|{{(({..{{{.,...(((((,,,||}}}..}}}})}))}|||}})),))))})},...)))))).)))).)))..))))).}))}})))))))).,)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).))))))))..)))))))))))))))))).))).}.})))).)
Forensic Context

No forensic context available.