Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0029200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0117
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93496587-93515647 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92953357-92972417 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -283.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((......(((((((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))...........(((((((((.....(((......))).(((((((((((.(((((((((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).))).)))))))))))........(((((.((.(((.......(((((......))))).....))).))..))))).....((.(.(((....)))).))........))))))))).((((.(((((.((....)).)))))..)))).))))).....(((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).)))).))..))).....)))))))..)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((..(((((((......,({{(((((.((((..((.(((.......))))).)))).)))),..........(((((((((.....(((......))),(((((((((((.(((((((((((((((((((,,.((....)}{((({((.{{{{{,..{({((,,.||||}..||}.((((...((({{.,((((,,.})}}.}}}}}.....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....{,.....}}}..|||||.,{||((((({......))))|)....|||}}...,.|||,{{|||,.,,,))}}}.,,,.))))))))}}))))).))))))))((((.((.(((((.,,{{{{{,,,.,,.)}}}},}.....{{{.(((......)))))).))))))}.)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).))).))))))))))).{{({...{(({,.|||,..|||,...{||||.,,...)))}}|,,,||||,}}},}}||......}}},}|||||,.,,,,,}}|.,.....))))))))).{(({.(((((.((....)).)))))..)))}.}}}},.....{{{((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((.....,,,,,((.{{{.........))),)).((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).)))).))..,}}.....)))))))..))}....
Forensic Context

No forensic context available.