Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0029300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0438
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93496587-93522513 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92953357-92979283 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-402.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -426.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 280.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.......)))))((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))((((((.((((..(((((......(((((.(.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((...((....))(((((((.((((((..(((((...)))))..))))((((...(((((..((((...)))).))))).....))))....((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...)))))))))))))).))))))))((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).)))).........))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).))).))))))))))).((((....((..((..(((((((((.(((((......)))))...(((((((.(.............).)))))))..(((.((.(((..((((((.((.(.((((.(((((.((....)).)))))..)))).).))......(((((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).)))).))..)))................(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).)))))))))))....))))).)))..)))))))))..))..))...)))).....(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))..)).)))).).)))))......((((.(((((....)))))))))..........))))).)))).))))))............(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,{{(,,.....))),|((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))|{{(((,(({(,.{{(((,{....{((((.(.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((,,.((....)}{((({((.{{{{{,..{({((,,.||||}..||}.((((...((({{.,((((,,.})}}.}}}}|.....}}}}....((((,.,((({....}))))))))....{,.....}}}..|||||.,{||((((({......))))|)...,||||}..,,.|||,{{{||,.,,,))}}}.,,,.))))))))}}})))).)))))))){(((.((.(((((,{,,,{{{,,,.,,,}}}}},,.....{{{.(((......)))))).)))))}}.)))},,.......))))))...(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).))).))))))))))|,(((,....((..({{{(((((((({.{((((......)))))...{((((({.{..,{{......}}).})))))}..(((.{,((((..((((((.,..{.{(((.(((((.((....)).)))))..)))}.|,|{.,,,..{{{((((((.(.((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((.....,,,,,((.{{{.........))),)).((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))).)))).))..}}}..,....,,.......(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))))))))....))))}.)))..)))))))}})))}..)),.|)))).....(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).)))))..)).)))).).)))))......((((.(((((....)))))))))..,,.....,))))).)))),)))))),...........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..
Forensic Context

No forensic context available.