ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_CAPN12_0000400
Basic Information
Symbol
hsa_CAPN12_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0029
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
19:39220607-39220994
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38729967-38730354
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-101.80
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-108.95
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
80.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((.(((.....((((...(((((((((..........(((((.(((.........(((.(((((..(((((((((((((.((((((...(((((...(((((((..((.......((((((...........))))))........))..))))))))))))(((((.........))))).........))))))))))))))))))).............((((((...(((((((.(((((((..((............)).....))))))).)))))))...))))))))))).)))...))).)))))(((((.((.((((.(.........).)))).)))))))......)))))))))))))....)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
{(((.(((.....((((...(((((((((..........{((((.(((.,,....,,(({.(({{,..((((((((((((((((((((..((((((...(((((((..{{..,,,..((((((...........))))))..,,,...}}..))))))))))))){{{{.........)))}}.........)))))))))))))))))))..........,,(((((((,{.(((((((.(((((((..((............)).....))))))).)))))))},.)))))))))}),))}..,))).))))|((({((((.((((.(.........).)))).))))))),.....)))))))))))))....)))))))....
Forensic Context
No forensic context available.