Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0029400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0443
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93496587-93527730 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92953357-92984500 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-501.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -532.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 388.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.