Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0030700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0025
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93498653-93515647 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92955423-92972417 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-208.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -223.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((..(((((....)))))))))...(((...(((....(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))...)))...))).....)(((((((.(((((.((((.((.(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).))))))).))))((((....))))......(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).((((.(.(((.((((((((....((((.(((.............)))))))....)))))))).))).).).)))............(((((.((..((((.........))))..)))))))(((((.((....)).)))))((((((.((.(......).))..))))))((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((..........((.(((.........))).)).((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....)))))).......................))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((((,.,((({....}))))))))....,,.....|||...,|||,,({{((((({......}}}|||...,|||||....,}}}},.|}}},,|{||{{{....}))},,}},.)(((((((.(((((.{(((.{{.(({((,,,{,,,,,,,.|||}}}}},,.....,{{.(((......})}}}},}}}}},,.||}|((((....))))}.,,,.(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).|,{{.{((((((((((({(....((((.(((..,..........)))))))...,))))))))||)}|},}.}||......,,,.,|(({||,{|,,{(((.,,....}})))}..)))))))(((((.((....)).)))))|{||||.{,,|..,,..|,||{{|||,|,((((((....(((.(.((((((((...((...(((((.(((((.((.(((((((((.....,,,,,((.{{{.........))),)).((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))((((((....(((.(((.....))).)))...))))))......))))))))))))))))...))))).))...)))))))).).)))....))))))}.}}}}.}}..,,,.........))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.