Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0033200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0078
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93510555-93540633 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92967325-92997403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-557.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -588.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 380.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...........))))((((.((..((((.(.(((.((((((((....((((.(((.............)))))))....)))))))).))).).).))).......((((....(((((((((((.........))).(((..((((((((((((..((((((((((((.....(((((((((.((((((((((((.............(((....)))..........(((((((((..((((((((((((((.((((((((((((.........(((((((.((((((((.(((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......)))))))))))..((((..(((....)))..))))((((((...(((((.(((.(((.(........).))).)))((((((.(((((((..((((((((.(((.(.....).))).))))).)))...)))))))...(((((.(((((((((....))))...(((....))).....))))).)))))(((..((......))))).(((((((..(((((.(((((.((((...((.(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))((.((........)).)).....((((.(((((....)))))))))..(((((........)))))..(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........((((..((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......))..)))).))))).))))))))))))..................(((.((.....)).)))..))))))....)))))))))))...))))))).......)))))))))))))))))(((((.......)))))...............))))))))).....(((((....)))))(((((((....)))))))..................(((((........(((..(....)..)))........))))).)))))))))....)))))).))))))....((((((((.....((.(((.....))).))))))))))((((((.((((((((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...((((.....))))((.(.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....))))))))))).))))))...........((((...))))))))))))).(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......))))))))))))....(((((.............)))))....(((..((..(((....((((((.(((((.(....)))))).))....))))..)))..))..))))))).)))..)))).))))).)))..))).............((((.((.......)).)))).....(((((........)))))(((((.((((((((.....))).))))).)))))))))))))....))))((((.......(((((.(((......)))...)))))))))........))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({{.{(((({{..,.{(((({....{{((.{{((({((((((,(....((((.(((..,..........)))))))...}))))))))}|)||,.,.|||.......{(((....((((((((,(({(({..{{{||{{(,(.{(((,(((((,((..,,}|,|||||(({{{,.((,(,,,,,.|{||{{||||||...}},,,,....(((....)))....{{,...(((((((((,.((((((((((((((.((((((((((((.........(((((({.((((((((.{((.........((((............)))).....(((((((((...)))))))))......))}))))))))..,(((..{{,....})),.}}||((((((,..{((((((,..,,,.,...,},,,}.|||.||{((((((.(((((((..(({(((((.(((.(.....).))).))))).}))...)))))))...(((((.(((((((({.{{{|,,,...|||,..,))).....})))).)))))(({{,{(.....,)}})).{((((((..(((((.(((((.(((({..,..(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).))))){{.({,,......)).)).....((((.(((((....))))))))),{{{.{......,,))}},...(((((((((........(((((......(((((((.....)))))))((((.((((.....))))))))..)))))((((..((((((........))))))..))))..(((...(((........,(((,.((((...)))).)))).......)))...)))))))))))).......,.,.}))).))))).)))))))))))}..................,||,{(.....}).,,,..}}))))),,,))))))))))),..))))))).......))))))))))))}))))(((((......,)))))...............,}}|||}}}....|.(((({...,,,,((((((((....)))))))).................}},}}}}}.}...{{{..|....},.))).,,.....,,,...)))))))))...})),,,))))))))....((((((((.....((.(((.....))).)))))))))),,,,||}|||,,(((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).,{{((({,.,,.({,...{(((...{{|,|((({(,({(,((,({{..|,|||||.},}..((((((.(((...)))))))))...|||}}}}},,{((((.....))))}||||||{||||,,...{{(({.,.((((...)))),),),)))).(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......)))))))))))),...|||||,,.........,,)))))....{((..((..(((....((((((.(((((.{....}))))).))....))))..)))..))..)))})))}))}..})},.}))),,)))}})),................|}||},...,,})}|)))},...((((({,...,}.)))))(((((.((((((((.....))).))))).)))))))))))))....))))||||..,,...{{{|{.{||..,,,,))}...))))))),)}}}}},..,,....,)
Forensic Context

No forensic context available.