Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0039400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0138
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
15:93523046-93523369 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92979816-92980139 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-122.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -128.01 kcal/mol
Frequency: 0.0001
Diversity: 43.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.