ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_CHD2_0042200
Basic Information
Symbol
hsa_CHD2_0042200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0054
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93528728-93536228
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92985498-92992998
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-111.60
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-114.99
kcal/mol
Frequency:
0.0041
Diversity:
41.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((((.....((.(((.....))).))))))))((((((((.((((((((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...((((.....))))((.(.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....))))))))))).))))))...(((((.(.((((...)))).).).)))).(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......)))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((.....((.(((.....))).))))))))((((((((.((((((((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...{(((.....)))|((,{.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....))))))))))).)))))),..(((({.{.((((...)))).).}.)))).(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......)))))))..})
Forensic Context
No forensic context available.