Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0042400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0112
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93528728-93540633 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92985498-92997403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 180.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((..((((((.(((((.......)))))....((((((...(((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...((((.....))))((.(.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....)))))).(((((((((....(((((((.(((....((((............)))).............)))))))))))))))))))..((((.(.((((...)))).).).)))..(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......))))))).((((....(((((.............))))).............((((.((...(((((.(((((..(((((...(((..........)))...)).)))..))))).)))))....)).)))))))).................))))))...))))))))))....(((((........)))))(((((.((((((((.....))).))))).))))).((..((((((........))))))..))(((.(((......)))...))).))))((.............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((,..((((((.(((((.......)))))....((((((,,,(((((.((,((((,(((,......}}}.)))).))))))).{{{{{,......(({...{({(...,,))}|((,,.(((.((.(,,..}.})))).)}}..((((((.(((...)))))))))...})}))}}}},{{({{.....,|||||.(((((((((....{{|||||,{||,..,{{{{........,,|.,,||,.........|||||}|}}}})))))))}}}}.,||||.{.((((...)))).}.,,}||..(((((((......(((((.((...(((......((((.((...(((((.((((.....)))).)))))..)).)))).......))))).))))).......))))))).,||,....{{,(({{{{{...{{{..,||}|,.,..{{..{,..(((,.,.{(((((.({(((,{...,})}}}},}}....)))}..)))..)),.))),.)),))..,))).)))))),),,)))}.................))))))...))))))))))....((((({,...,}.)))))(((((.((((((((.....))).))))).))))).{{..{{{{{{.....,,,}}}}}}..}|(((.(((......)))...)))}))))((.............))
Forensic Context

No forensic context available.