Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0042300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0196
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:93528728-93545547 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92985498-93002317 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-273.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -289.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.