Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0045200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0377
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:93538983-93541851 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:92995753-92998621 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-468.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -507.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 548.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((((.....))))))).((((.(((((.(((...((((((.((..(((.......)))....)).))))))...)))...)))........)).)))).)))(((.((.(..((((((((((((........))))..((.(((((((....(((.(((((.((((.((((((.((....)).)))))).)))).)))))..))).......))))))).)).....(((((((((...)))))))))..(((((((.((((((((..........(((.((((....)))).)))..)))))))).....))))))).((((((......))))))(((.((((((((((((((....)))).....(((((((((..(((((((((((.(((((....(((((((((((((((.((((((((((...))))))))))..((((.((((...((((((((((.(((((......(((.....)))...))))).)))))))))))))).)))).((((........))))(((.(((((((........((((...(((((((((((((((.((((...)))).))))))...........)))))))))..)))).(((((.((((((((((.((((((.(((((((.(((((.....)).))).))....((((((.(.((....)).).)))))).((((((((..((((((((..((((((((.(((((.(((((.((....)).))))))))))..((((......))))..............((((((.(((((...((((((((.....))))))))..))))).)))))).)))))..))).))))))))......(((....)))..))))))))................(((((((..(((.....)))..)))))))..........))))).)))))).....((((((......((.(((((.(((....((((......(((....)))......)))).....))).))))).))...))))))............(((((...((.((((((((..................)))))))).))...)))))...))))))))))...))))).........((((((((...)))))))).((((((.........))))))(((((.(((((....))))).))))).........(((.(((................))).)))(((((.(((((..(((((...(((..........)))...)).)))..))))).)))))...))))))).))).)))))))))))))))....))))).)))(((((((((...(((((........)))))(((((.((((((((.....))).))))).))))).........)).)))))))......((((...))))..........))))))))..)))))))))(((........)))(((((.(((.((......)).))).)))))......((((((....)))))))))))))))).)))((((((((..((((((..(((.....(((((..((.(.(((...)))..).))..)))))......)))))))))))).....((.(((((((((((((....(((....))))))))).....))))))).))......))))))))))..)))..))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{.{{(((((((.....})))}}}.|,|({(({,,.,||}}}{(((((.{{,{(,,.......}}}..},}}.)))))}..,|||{{{|{{{...,,,.}|,|{{|...{{((((((({{({(((.{,((({,.......}}}}...,}|||||{{,|||{{((((,{(((((((((({,.((({{(((,.{((((((({,,.||,|{,,{||{{{,,{{{{{..{{{|{{.{,,{((((((({...})))))))},,,((((((,((((((((.....,,...{||.((((....)))).))}..)))))))}.....}||||||{(((.{(((((,,,{((((((((((((((....,,((({((.(({(({{{(({...||}}}|.,,}}}}}.}}.})}|,{{{((((({,,,,,,,,,.((((((((((...))))))))))..((((,(({(,,.((((((((((.(((((......(((.....)))...))))).))))))))))}}}},))})|||||,.....{{||}||((.{....,,.,))}}}}|||,...(((((((((,{((((.((({...}})).))))}},......,,..))))))))){{|||{{.(((.,{(((((((((.((((((.(((((((.(((((.....)).))),))....((((((.(.((....)),),)))))).((((((((..,((((((,,.{{,{{{{{.(((((.(((((.((....)}.))))))))))...,{({{{.{{|{{{,.,..,,.{{{{..{((({{.|||{,..,||||||||}}}}},)))),||{{|||,|{||||,|.,,,),},,)),),))))))}.....|||,,..,}}..))))))))................((((((({((((.....},)))))))))).,,.......))))).))))))......,,((...(((((((((...{(,....{{{........}})),,...))))},))))...,}|||.||||...{{{....))),..,,,....,,.(((((...((.((((((((..................)))))))).))...)))))...)))))))))).)))..))}.}}}}...((((((((...)))))))).{(((((.........)))))}(((((.{((({....})))}.)))))})))))))})))))))..))))))}},,,...|||.|||{,,....,.)))},)))},..,}},)),)))}.|}}},..,}}}}}}.}}}}...,}}}..})})))}},}}},)))))))))...)))}}}))}}),})))}|||||,||,,,{{{{{{,...,},)))))|||||,||||||||.....)))})))))|)))))||.{,,,,.,,..,.,|||{.,,....(((((.(({......}))...)))))}}}),,,,,,,,,}},}}}}}|||||(({{,.|{{.{{|||,,.))}))}.,}}}).,...,(((|{,.||{|}},)),.,,..}}}|,{,{(({{((((..((((((.,,{{.....(((((..((.(.(((...)))..).))..)))))......,},)))))))),.,,..||.(((((((((((((.,{.(.....,)},)))))).....))))))).,}.....})))))))))})}})))}}},})}}
Forensic Context

No forensic context available.