Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0001800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0015
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
19:39168645-39171471 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38678005-38680831 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-941.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -992.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 663.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((..((((.(((((((((((..((((....((((((...((....(((((((((((((((((...((((((.((((((........(((.(((((((((((........))))))))))).))).....((((.((((((((..((((((((.........))))))))..(((((((.((((..(((...(((..((((((...((((((((...((.(((((((((((.(((((...........((((((((.....(((((((..(((...............(((((((.........((((.((((....))))..))))((.((((.(((......))).)))))).((((((((((.(((((((....(((((((............)))))))....))))))).))))))))))((..(((((((...............)))))))..)).....))))))))))..))))))))))))))))))))))).)).)))))).))...))))))))..))))))..)))((((((...((..(((((((.......(((((((.(((((((.((((((...(((((((..((...(((....((((((((((.....)))))).))))..((((..((((.(((((((.(((((((...((((....(((..(((((((((..........((((......)))).......(((...((((((((((((......)))..))).)))))).)))....)))))))))..)))((((((......((((....))))......))))))....(((((((((((...((.(((...))).))...)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))(((((((.(.(((((((...((..((((((((..(((((((..(((..((...))..))))))))))((((..(..((.((((.((((.((.((((((.(((.(((((...((((....(((((((((((((((((((((...((((.(((..((((....))))((((((.((((..(((((..(((..(((.(((....)))..)))..)))..)....)))))))).))))))..((((((((((...)))).)))))).......))).))))...(((....)))....))))))))))))))...))))))))))).))))))))))).))).)).)))).)))))).)..)))).(((...)))....)))))))))).))))))).))))))))((((.((((.((((((...((((.((((((.(((...)))..)))))).))))))))))))))...))))))).))..))))))).)))).......((((((((...((((((((((.((((((((((...((((((((((......)).))))))))(((((..((((........)))).)).)))...(((((....(((((........)))))......))))).....((((((((((((((....)))))))..))))))))))))))).)).))))))))))))))))))........((((((((...))))))))....((((((((((...((((((((.......))))))))((..(((((((((((((((..........)))))))..))).)))))...))(((((....(((.....((((((((....(((((......)))))....))).))).))...)))....)))))..((((((..((........))..)))))).((((....)))).(((..(((...)))..)))............)))))....)))))....(((......))).....))))))))).)).))))).......))).))))))...))))))..)))))))...))))))).((((((((((........((((((......))))))..........(((((.(((...............))).))))).))))))))))....)))))))).))))))))))...)))))).)))))........))))..))))))))..(((((((((......)))..)))))).))...))))))...))))(((...(((((((.(((.((.(((.....(((.((((((((((.((.......................................((((...))))((((.....)))).((((((((((((.((....)))).)))))))..))).)).)))))))))).)))..))).)).)))))....(((.((((...)))).))))))))...)))..))))))))))))))))))((((((((((((.((((...((((((((....((((((((((....)))))...(((((..((((...((....))(((.((((.(((((((((.((((((((((...................(.(((((((.....))))))).)..(((((((..((((((.(((((((..(((((....)))))..)))..))))...))))))))))))).....))))))..)))).)...)))))))))))).)))..))))..))))).)))))..)).))))))...)))).)))))).....))))))....((((...))))...((((...((......)).))))...........((((((((((.........................((.(((((.....))))).))...))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{,(((..((((.(((((((((((,,(({({,..((({{(,.,((|{.{((((((({(((((((((...((((((.((((((,.......(((.(((((((((((........))))))))))).))).....{{{{.{{(({{{{.{((({{{{{,{,.,,,,,|||}}}}|,{({((({{{(({{.((((,,,(({..{(((({...((((((((,{.(({(({,,,,{(((,({{{{,,{{,,,{{{{{(((({...{({{{,,,,{{{,,....,}.,.,,,,,...,{{{|||.......{{((((.((((....))))..))))}))||||,{{{|,....},,.)},|||,((((((((((.(((((((....(((((((............)))))))....))))))).))))))))))||,.((((((|...,,..........})))))).,)),.,,,|||||},....|||}||||)}||}}}})}}},|||{|},},}}}}|)}}||}}}}}}}}.,}})}))..}}}{((({{{{,{{..{{{{(({...{{{{((({,,{{{{((((,...((((...(((((((..((...{{,..,.((((((((((.....)))))).))))..((((..((((.(((((((((((((((...((((....(((..(((((((((..........,(((,.....}))),......{((...((((((((((((......)))..))},)))))).}})....)))))))))..)))((((((......((((....))))......))))))....(((((((((((...{(.(((...))}.))...)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))(((((((,(.{((((((...{{.,((((((((..{((((((..(((..((...))..)))))))))}((((..{..((.((((.((((.((.(((((,,(((.(((((...((((....(((((((((((((((((((((...((((,,,{..{({{,,..}}}}((((((.((((..(((({..(((..(((.(((....)))..)))..)))..)....)))))))).))))))..((((({((((...)))).}))))).{{,,,.,,,,))))...(((....)))....)))))))))))))))..))))))))))).))))))))))).))).)).)))).)))))).}..)))).,((...}},....)))))))))}.))))))),))))))))((((.((((.((((((...((((.((((((.(((...)))..)))))).))))))))))))))...))))}}}.))..))))))).)))),{{({({.(((((({,(.((((((((((.((((((((((...((((((((({......|}.},,{||||,{({{..{|||,,.....,|},,.))).||||.{{,.....,}|,||}},,,,.,})}}}......,,,,,.{{{{((.,,,{{,,,,,.....,,)))))}}))))))).)),)))))))))),)))))))))))))))....,,,,((((((((...))))))))....,((((((,({...(((((({{,.....,}}})))}){{{{(((((((((((((((..........)))))))..))).)))))...,,.)))).,..|||.,,,,||{{{{{{.,..(((((......)))))....}}}.))).)),,,)))}},}))))...((((((..,,......,,}|..}}}))).||||....}}},.{{{,,{{{..,)))..}}}.......,,,...,,,,,)))}.}))}}}}}||,,..}})))})}))})))))))},,},,)})},}.}}}}))},}))),,...,}})))}})))))))..,))))))}.((((((((({.......,((((((......)))))).,........(((((.(((...............))).))))).))))))))))..,})))))))).))}}}))}))...)))))).))))|.......}))))..)))))))}..({(((((((......)))}.}))))),)),..}}})),...}}}}(((...(((({{{.(((.((.(((.....(((.((((((((((.({.........................,......}}},...((({...||||((((.....)))).({{(((((((((.((....)))).)))))))..))}.}}.)))))))))).)))..))).)).)))))...,{((,{{{,...}}))}))))))))...)))..})))))))))))))))))((((((((((((.((((...((((((((....((((((((((....))))),..,{{((,,((({...{{,...},(((.((((.(((((((((.((((((((((..................|{.(((((((.....))))))).,.,(((((((..((((((.(((((((..(((((....)))))..)))..))))...))))))))))))).....)))))}.,)))).)...)))))))))))).)))..})))..}}))),,))))..)).))))))...)))).)))))).....))))))....((((...))))...((((...((......)).)))).,.,.}..{{.((((((((((.........................{{.(((((.....))))).}}...)))))))))).,.,
Forensic Context

No forensic context available.