Basic Information
Symbol
hsa_ACTN4_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0067
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
19:39171031-39171552
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38680391-38680912
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-215.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
66.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.((...)).)).).)(.((.((((((((.(((((((.((((((((((.((((((((((....(((((..(((((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((...................(.(((((((.....))))))).)..(((((((..((((((.(((((((..(((((....)))))..)))..))))...))))))))))))).....))))))..)))).)...))))))))((((.((((.........))))))))..(((((........)))))(((((.....)))))......((((...))))...((((...((......)).))))...........((((((((((.........................((.(((((.....))))).))...))))))))))..(((........))))))))))))))))))))))..))))))))))))))).))))))).)))))))))).)))))))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.((.((...)).)).}.|(.((.((((((((.((((((({((((((((((.((((((((((({,..,{((..(((((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((........,.........|{.(((((((.....))))))).,.,(((((((..((((((.(((((((..(((((....)))))..)))..))))...))))))))))))).....)))))}.,)))).}...))))))))((({{((((.........)))))))).,(((((........)))))|((((,...,))))}......((((...))))...{{{{...((.,,,..,,.}}}),....,.,{,.((((((((((.........................{{.(((((.....))))).}}...))))))))))..,,},}.,},,....)))))))))))))))))))..))))))))))))))).)))))))},))))))))).)))))))).)),)
Forensic Context
No forensic context available.