Basic Information

Symbol
hsa_CHD2_0050700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD2_0418
Host gene
CHD2
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
15:93551673-93563488 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:93008443-93020258 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-408.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -437.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......((((.....))))...((((......))))(((((..(((.((.....))))).)))))..))(((((.(((((..(((.((((....(((((.((..((((((.((((.......((.(((((((..(((((.((.((((....(((.((((((.((((((((.((((((((((((.(((((((((..((((......))))..((((.((....(((((....(((((((((..(((.((.((((((((..((((((((((((((.((...(((((((((.((((..(((((((....)))))))...))))............(((((..(((((....(((((..........)))))....))))).)))))(((((((.......((((((......((..(.(((((((...))))))).)..))...)))))))))))))...))))))))).)))))).(((..((((((((...))))))))..)))))))))..))))..))))((((((.........))))))..((((((((.........((....))....(((((((((...(((.........)))...)))))))))((((((((((...))))))))))...((((((((((((((..((..((....))..))....)))).........)))))).))))))))))))..((((.(((((...((((...((((((((.....((.((.....(((......))).....)).)).....)))((((.......))))...)))))(((((..((((((((((((..(((((((.(((((...((((..((..((...((((.(((((((((.(((((((((((((...)).))))).)))))))))))....((((((.(((.........)))))))))......))))))))))..))..))))(((........)))..................((((.((.(((..........))))).))))..)))))))).))))....))))...))))))))...)))))........)))).....))))).))))..)))).)).)))..)))))))))....)))))....))))))......)))))))))..........))).)).)))))))((.((....)).))...)))))))).)).)))))))......(((...(((((((((((.......))..)))))))))...)))....)))).))..)))))..))))))).)).....((((........((((..((((.(((...(((....)))..)))))))..........)))).......)))).)))).))))))...))..........))))).)))).)))..)))))...............)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......((((.....))))...((((,....,))))(((((..(((.{(.....)}))).)))))..))(((((.{((((..(((.{{{{....,{,,..{{{{.(((((((((((((,({,(({((({(({..{({({,((,((((,,,,((({((((((.((((((((.((((((((((((.(((((((((..{(((......)))}..(((,{((.{,.(((((....(((((((((..(((.((.((((.((,..{,,...,,{(((,{((({(((,,{{((((,((((..(((((((....)))))))...))}|,,,,.....,,,|,|||,,{{{{,,,..||}|||}}}}},,}}}|||}|.,})||||.(((((((((.((((((....,..,....,)}((..(.(((((((...))))))).)..)).)))))).,})))))))}}))}{(((({..((,{({(((..((((((((...))))))))..))),,{({((,{....,|||||(((((,,.....,,}}})),..||||,,{{,.{{{,..{(({{{.|,....(((((((({,,.{((.........,))...)))))))))((((((((((...))))))))))...((({((((((((((..{(..{{....)}..))....))))........,)))))).}))))))))),)}}}}||.{(((,{{{.{{....{((,,,{(,....,.,}}.....|||.....))),))}}.,)}))}.,..||||{((.......)}))..,}}}}.||||{..{(((((((((((..(((((((.(((((...{{{{..{{...,...((((.{{(((((,({(({(({,{{{{{|..,||,,,},,.,}))))}}}}}.}}}|,||||||||}}.....||},,},)))}......})}))))}....}}..}))}(((........)))},,,..............((,(,{{,(((,,,.......})}}},))))..)))))))).))))....))))...))))))))...))))).}},,.))),})..,,}))),},,,,)).)))).)).)))..)))))))))....))))).}}.))))))......)))))))))..........))),,)}))))))){{.({....}).})...)))))))).)).)))))),......{{{,..{{{{|||||||,,,,,,.,,..}))}))))),)}),,,,,,)))).}}..}}})),.}}}}}||{{|{..,{((,({.,,....{||{,,((((.{{(...(((....))}.,)})))))...,...,..},,........)))}.,,.,,.))))),.,}))}}}}.,.},,}})),)))),)))..)))))....,.,........)))))
Forensic Context

No forensic context available.