Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0136826 hsa_circCHD7_015 hsa-CHD7_0005
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61693559-61714152 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60781000-60801593 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-168.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -185.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......((((.((..((((....))))...)).))))..))).(((...(((.(((((.((.(((((((((.((......(((((.........))))).....))))).(((((........................((((.....))))....(((..(((......((.(((((((..........((((....))))......))))))).)).....))).))).((((((((((...........................((((...(((..........((...((...........))...))..........)))...((...))..)))).........(((..(.(((.....))).)..)))........(((.....))).........)))))..))))).....(((((.((........)).)))))..(((((....))))).........((((.....(((.........((((.((((....))))))))..........)))....((((((((((((....(((((.(..((((((((((.(((((...((.((.(((..((......))..).))...))))...))))).)))))).))))..).)))))...))))))).))))).((((....(((((((((((..((........))..)))))))).)))..((((((....)))))).))))...))))..)))))...........)))))).))))))).)))....).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,{,.,{{((.,{..(({{....)}},,,.}}}}})),.}}}.{{,...(((.(((({,({.((((({(((,,(,....,(({{,.|},,{{{,|||||{{{{{.||||{((.,,........................{{{{.....}))).,,.(((..(((......,(,(((((((.....{,.{{{(((....)))),,..,.))))))}.))...,.))).))).({(({(((((.,.........................((((...,,,.......}}}|{...{{...,.......,},..||..........|}}...||..,}}..,.,},,....,,.{{{..,.{{{,....},}.,..,))........(((.....)))...,,,...)))},..)))}).....{((((.((........)).))))|{,(((((....)))))}..,.....,,},.....(((.........(((,{((((....))))))))..........})),,..((((((((((((....(((((.(..((((((((((.(((((...((.((.(((..({......))..}.}}...))))...))))).)))))).))))..}.)))))...))))))).))))).||,....}||||||((((({.....}}}}}}....}}|||},|,,,,..,.}}|}}..}))))))})))))..,|||..,})))...........)))))).))))))).)))....}.})
Forensic Context

No forensic context available.