Basic Information
Symbol
hsa_ACTN4_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0028
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
19:39189041-39190038
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38698401-38699398
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-416.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-434.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
350.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((....)))).)((((((.....(((((((((.(((((.((((((((.((.........)).)))).))))))))).))))(((.(((.........))).)))..((((((.(..((......))..).)))))))))))......))))..(.((((((..(((.((((((((((((((((...(((((((((.((((((.(((.....))))).))..)).)))))))))((((((..((((.(((.((((((((((..(((((.((((.(.(((...))).).))))...))))).))))))))))))).))))...)))))))))))))((((((.(((((.((((((((((...))))))).)))))))).)))))).(((((((((((..((.(((((((((.......))))))))).)).....((((((((.....))))))))..((((((((((..((((((..(((((......))))).((((((...))))))...........)))))).))))))))))((((.(((((((.((.((((((....((((((.(((((...(((((((((((.((((......((.......)).....))..))))))))....)))))))))).))))))..)))))).))))))))).))))....(((((..((((((((....)))))))).)))))...(((((((((..(((((((..((((((.((((....(((((((((.(((...........((.(((............))).))))).)))))))))..))))(((.(((((...((((((((......))....))))))..))))).))).((((....)))).((((((.(((.(((...)))))).))))))))))))..)))))))........)))))))))...)))))))...))))............)))))).))).))))))))).)...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((....)))).)(((((,.....||}}|((((.((((((((((((((.((.........)).)))).))))))))).))))..{{{((,..,,||,.,.|{||,..((((((.(..((......))..).)))))),}|||.{{,.,||||||||(((|((.,((({((((((((((((({((,.,((((((((((((((({{({(...,|))))).||,.,},}}}})))))|{{{{{.,|{{{.||(,((((((((((,.(((({.((((,(,{((...}}).).))}).,,}}}}|,|)))))))|||||,}}}|,{.,,|||||||}}}|((((((.(((((.((((((((((...))))))).)))))))).))))))}....|||||||,.((,(((((((((.......))))))))).}}......{{{{{{,,|,|,}})))))}||((((((((((..((((((,.(((((......))))),(({{{,},,}}}}},...,.,..,}.)))))).)))))))))){{{{.{(((((||((,({((((....((((((.(((((...(((((({((({.,,{{.,..,,|||,,.,.|||.....}},.}||}}})).,..)))))))))).))))))..)))))).))))))))}.)))}..,.|((((..((((((((....)))))))).))))},}.|||{(((((.|{((({{{,,{(((((.,{({.,..(((((((((,(({....,.{{{{.,{||||......|||,,.|}|}}}}}}.)))))))))..)))}{||,|||{{...{{{|||{{,,.,,.}|,,,,|}|)}},,}))}|,}}}.{(((....)))).{(((({.(((,{{{...))}))).)))))))))))},.,)))))},,,}....)))))))))..,)))}})}|,,||,|.,}}},.....,)))))),))),)))))}))).}},,})
Forensic Context
No forensic context available.