Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0123
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:61707545-61716662 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60794986-60804103 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-739.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -798.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 676.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........((((..((..(((((....)))))..))....))))......(((.........((((.((((....))))))))..........)))....((((((((((((....(((((.(..((((((((((.(((((...((.((.(((..((......))..).))...))))...))))).)))))).))))..).)))))...))))))).)))))..((....)).(((((((((..((........))..)))))))))((((.(((((((..(((((....)))))..(((....)))........((((((((((((.....((((.((((((..(((.(((.((((((((((.(((..((((((((((.......)).)))))))).))).))))((((((((...................))))))))........)))))).((((((.((((..(((((...(((.((.(((((.........))))).))..)))....)))))..)))))))))).....))).))).)))))).)))).(((((...)))))......(((((..(((((.(((.((....)).))))))))...)))))...)))))).....))))))........................(((((((((....((((((.....(((....)))..(((((....(((((((((((((((...)))).))))))))))))).))).(((((((..(((..(((((((((((((((..........((((...))))((((((.((((((...((((((((((.((.....((((((((((((..(........)..)))))))...((((...((((((.(((((................((((((....)))))))))))))))))..))))...))))).)).))))).))))).((........((((((((((.....(((((((((((((...................((((((.((((((.((....((((.((((.((((((...((..((...(((((((.((..((..(((((((..((((..(.(((((((((.(((((((((((.(((((.....(((((.(((.((((((..((((.......))))..)))))).(((.(((((.(((((((((((((((((((..(((............((((((((.((.((((.....((((.(((.((((...))))))).)))))))).))))))))))...........)))..)))))...))).)))...))))))))...((((((((((.....((((((...(((.(((((.(....((((((((.(((..(((((...(((..(((..(((((.....)))))..)))..))))))))...)))..)))))))).).))))).)))...)))))).(((.(((((((.....))))))).))).....))))..))))))........)))))..)))..........))).)))))......))))).))))).........))))))(((((((((((.....................))))))..)))))..((((((.(((..((((........)))).))))))))).((((((.((((......)))).)))))).((((((((..(((((((((((.(((((((...((((..(((((...(((((.(((((.....))))).)))))...............)))))............))))...))))))).).)))))...))))).......(((((((.(((..(((....)))))).)))))))((..((.((((((((((.(((((..((.((((((.......((((((((....((((((((.....((((((..(.(((((......))))).)..))))))........))))))))))))))))....)))))).)).)))))..)))))))))).))..))..))))))))..))))))))))..)))))))))))(((.(((((((.......))))))).)))..((((((...))))))..))..)).)))))))...))...))..((((((((((...((((((((((((.(((((((((((((.........))))(((((((((..((((((((...)))))..)).)..)))).....)))))..(((((.......))))).....((((((..(((((.(......).)))))..)).))))........)))))))))........((((.......)))))))))))))))).)))))))))).............)))))).)).))..)))))).))))))..))))))))))))))))))).))))))))))..........))...))))))))))))..(((((.(((((.(((((.......(((((...........))))).......))))).)))))))))).........))))))))))))))).....)))..)))))))..))))))....))))))))).......))))))).))))..(((((((.(((................))).))))))))(((((......(((((((((((((((((((((..((.((((.(((....))).)))).))..))))..)))))))...((.((((((......((((((((((..((((..(((.....)))...)))).)))))))))).....)))))).))...((((((((....))))..)))).)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........((((..((,.(((((....)))))..})....))))......(((.........(((,{((((....))))))))..........})),...((((((((((((....(((((.(..((((((((((.(((((...((.((.(((..({......))..}.}}...))))...))))).)))))).))))..}.)))))...))))))).)))))..((,,..,|{(((((((((..,,........,}..)))))))),|||,.(((((((..(((((....)))))..(((..,,|||.,,.....{{{(((((((({,,,,,((((.((((((..(((.(((.,|{(((((((.,,,,.((((((((({,,.....)),)))))))).))}.)))))}|,.,,{{{{.,,,,|.,|,....,,|||||}}},.,.......,,}},|||||,.,,,{.,,{{,,...,{{,,..(((((.........))))).||,,{|....})))}}..}},,..,,,,..,,.))).))).)))))).)))).(((({...}))))..,,..(((((..(((((.(((.{{....}}.))))))))...))))).,.)))))).....})}}}}...,,.|||...............(((((((((....((((((.....(({.,,.,,,..||||||.,.(((((((((((,((,...,,)).))))))))))),}.}}}.(((((((..(((..((((((((((((((({.........{((,...,))}((((((.((((((,,,((((((((((.((.....((((((((((((..,........,..)))))))...((((...((((((.(((((................((((((....)))))))))))))))))..))))...))))).)).))))).))))).||,.......((((((((((.....(((((((((((((...,{({.((((({({...,,,{{{,{{{,,({(,....((({{.((({(((((({{((..{,{{,.|{{{{({((({{(((...(((({..........,}}||,.}}}}}.}}}}}.,|||,......}}))|,||||||((((((..(((({(....|))))..))))}|||}}}.)))))||.(((((((((...((((((((((.(((..{{{{.{((((((((((.((((.....((((.((((((((...))))))).)))))))).)))))))))).........,,,,((((((,{,..,..{{((((((,.{({{{,,,(((((((({......((((((..,(((.(((((.,....((((((((.(((..{((((.,.(((..(((.{((((,.....},)))}})))..))))}))),..)))..)))))))).}.))))).)))...)))))).{{{.(((((((.....))))))).}},....||||},.}})}}),,,.,,.,{{{(.......,..}}}}|,,,.,,{{{{{,,||{(((({((({(({,..{(((((((....)))))}|,......,.,,,..,,,.,{((.{({({{{..{{||,..,|.)))),,|}}|,||}}},....,,,,.|}|{{(((..((((((.((((......)))).))))))..))))}||..(((((((((((.(((((((..,((((,,(((({.,.(((((.(((({.....})))).))))).,,..,.,,...,,,})))).,,.........))))...))))))).).)))},..|))))).......(((((((.(((..(((....)))))).)))))))....||.{(((((((((.(((((,,{(,{{{{||},,|...((((((({...,((((((((,{...((((((..,.(((((......))))).)..))))))...,,,,.))))))))))))))))..,,}}}})}.,,.)))))..)))))))))){||..,},}))}}}}}},})))})))))))))))))}......,,.(((((((.......))))))).)))}}})))}))))))}}||{{|,..............|||}},((((.{{,{{|||{{{{((((((((..,,,,....,{.{((((.........}))}|...((((({.{{,,,,,,...))}},})))}}.,}}}.,|,,.,|}}}..,,}},,,,,,})))))|,}}})))).)))...))},)))})))),..))).))))))))))..)))))))))}|{{........{{{,....}}})}},})))))))),),.))),,,))),},,,,},,....}))))))),)}),,{{{|,,..,,,,,,)))),,,.))))))))))))).))))))))))...............))))))))))))..(((((.(((((.(((((.......(((((...........))))).......))))).))))))))))....,..}.})))))))))))))).....)))..)))))))..))))))....))))))))).......))))))),)))),,(((((((.(((...,,...........))).))))))))(((((,.....(((((((((((((((((((((..((.((((.(((....))).)))).))..)))),.,))))))...{{.{(({{{.,|,}.{{((((((((..{{(({,{((.....))))}},}}}.))))))))||{{{{,,,,,))}))},,((((((((....))),.,)))).)))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.