Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0087
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
19:39191240-39202001 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38700600-38711361 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-634.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -664.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((..(((((..(((((.(((((.....))))).................((((((..(((((((.((..((((...(((....)))))))))))))))).)))))))))))..).))))...))))(((.(((((((((.(((((..((((..........))))........(((((.(......))))))..((((.((.((((((((((.(((((((((((((...(((((........))))).((((..(((((..(((...((((((..........)))))).)))))))).))))(((.(((..((....))..))).))).((((((.(((((((....))))))).))..))))....(((((.((((...........(((((((....).)))))))))).))))).))))..)))))))))....((((.(......).))))..((((((((.((((((.(((..((..(((...))).))..))).......(((((((.((((.(((((......)))..(((((.(.(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).)))....(((((.....(((((((.(..(((..((((.((((((.....)))))).))))..)))..))))).....((((..((((((..((((.((.(((((((.((((((((((.(((((((((((((((.(((........))).)))))..((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((..((((....((((((((((...(((((.((.....)).)))))))))).))))).))))..)))))........(.(((((....)))))).(((((((....)))))))..........((..((((...))))..))............))))))..)).))))).))).))).)))))))........)))))))))))))..))))))))))))).)))))))))..((.(((((....))))).))....)))).))))))..)))).))))))))).))))).)))))).)))))))((((...))))....)))))).)))))))))))))))))).)).(((((.((((((.((((((.((.((((..((((......(((((((((((.((((((((.((...)).))))))))......((((.((((.((((....))))........((((((((.....))))).)))......((((((((...((((...))))...................(((((((((...)))))....)))).))))))))....))))))))((((.(((.(((.......))).))).))))..........))))))))...)))...((.(((((((((((.(....(((...(((((....))))).....)))..).))))))))))).))..)))))))))).))))))...)))))).)))))))))..))))))))))))))))).....((((...........))))((((((.((...(((((((((...((.(((......))).))..........))))))))).)).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,.{,((((..(((((..(((((.(((((.....))))).......,,,,,.....|||||{..((((((({,(..((((...(((....)))))))})))))))).}}))},)))))..)},)))...))))(((.(((((((((.(((((.,((((..........))))........(((((.(......))))))..((((.((.(((((((({(,(((((((((((((,,.(((((...,,,..|}}}},((({,.{{{{{{..|{,},|{{{{{|||,|||||.|)|}}},}.|||||||,,}}|||.|||,.{{,...}}..))).))}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,{{.,..|,,|..,}}}}....(((((({....}.))))))}}))}))),,,))))..)))))))))....((((.{......}.))))..((((((((.((((((.{((..{(,,{....}))).}}..|||,......(((((((.((({,(((((......)))..{{{({.,.(((.((((((((((.(((.{{({((.....,{{({{(......}}....))))...))),))).)))))))))).)))..,.(((((.....(((((((.{..(((..((((.((((((.....)))))).))))..)))..,)))).....((((..((((((..((((.,(.(((((((.((((((((({.(((((((((((((((.(((........))).)))))..((((((((((((((({.((((((((((.((((((,(((,..{(((....||||,((,(,,{{(((,({(({{{,{||,|||||,||||.|||||{||}|,,}|}|}.......||||{|{|,,.,)))))})))}|,||}||.,||}}}}...........,))}))}.)})))).),))....},}....))))))..)).))))).))).})),}))))))........)))))))))))))..))))))))))))).))))))),),.((.(((((....))))).)).,}.)))).))))))..)))).)))))))),.)))}).}))))).))))))){{{|...))))....)))))).)))))))))))))))))).)}.(((((.((((((.((((((.((.((((..((((......({{((((((((.((((((((.((...}).)))))))),||,,,((((.(((({((((..,,||||.....,,,((((((((.....))))).)))......((((((((...,(((,..,||,...................{(((((((,...}))))....)))).))))))))...,|}}}}))}||}},||,.,||}..,.,,))),,}}}},}))).,,.....))))))))...)))...{{.(((((((((((.(....|{{...(((((....))))).....,,),.,.))))))))))),)).,)))))))))).))))))...)))))).))))))))),.))))))))))))))).))),.,{{,{|.,...,,}},)},|((((((.((...(((((((((...((.(((......))).))..........))))))))).)).))))))..
Forensic Context

No forensic context available.