Basic Information
Symbol
hsa_CHD7_0007400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0031
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61712947-61736575
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60800388-60824016
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-317.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-340.47 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
227.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(...(..((((((((.(((((....((...........))....)))))...........(((((((..(((((........((((...))))..((((((.....))))))....)))))..)))))))((((((....)))))).(((((...(((....)))...........(((((....))))).........((((.....))))((((((((((((((.((....))))))))..............)))))))).((((((..(((.((((((.((........((((......))))..((..((.((((..........((((((...(((((((.(((((((......(((((((((((((((((((((.....)))))))))..........((((((((.(((.....))).((((((((((........((.((((.....((((.((.(((.((((.((.(((((((.....))))))...........).)).))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)).))))))......))))...))..))))))))))))))))))((((((.((((......)))).....(((((...((((................))))..)))))((((((((((((((((......))).))))))))))))).....(((((....))))).))))))((((.(((((..(((((........))))).))))).))))((((...))))....))))))))))))...))))))).)))).....(((((((((.((.((((((((.(((((.(...(((..........)))...)..)))))...).))))))).)).))))).).)))))))))))).((((.(.(((((((((((((....((((....((((((....(((....)))...))))))....))))))))))).((((((.(.......).))))))...)))))).)))))...((((.(((....))).)))))))).))..))......)).)))))).))))))))).......)))))..)))))))).)..))((((........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.,...,..((((((((.{,,.,........(((((((....(((...(((.((((((....(((((((..(((((........((((...))))..((((((.....))))))....)))))..)))))))((((((....))))))..,,{((..(((((.((({{,......,,,(((((....))))).,,......((((.....})))(((((((((((({{,((....}})))))){{,...,,}.....)))))))).,,}}}..}}))).))))).}}}...,.,.{(((......})}}..|}...,}}.{{...,{{{{...,|||}}..,||,{{{.(((((((......(((((((((((((((((((((.....}})))))))|...,,....((((((((.(((.....))).((((((((((..{.....,,.((((.....((((.((.(((.(({{,{{,|((((((,...,)))))}.....,.,,.}},}},))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)),})))))......))))...}...)))))))))))))))))){(((({{((((......))))}....{((((...((((................))))..))))|((((((((((((((((......))).))))))))))))),....{(((,....})))}.})}))){(((.(((((,.{((((........))))),))))).)))}((((...))))....))))))))))))...))))))).}}}|{{{..{{(((((((.((.((((((((.(((((,{,..{((..........)))...}..)))))...).))))))).)).))))).),}},))))}}},,.((({,(.(((((((((((((,...{(({....((,((({...(((....)))...)))))).,..))))))))))).((((((.,.......).)))))}...)))))).})))))))))).)))....)))..))))))).((((((,.(((.{..((((....))))......)))..))))))..)))))))).},.))((((........))))
Forensic Context
No forensic context available.