Basic Information

Symbol
hsa_TMEM165_0001800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0126620 hsa_circTMEM165_003 hsa-TMEM165_0005
Host gene
TMEM165
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:56269403-56284152 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:55403236-55417985 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-175.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -189.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((........((((((((((.((((((........))))))))))))))))..((((((((((.(((((((((.((((((((((..(((...)))((((((...............(((((......(((...........)))....))))).((((((....)))))).........))))))((((((..(((..((((.(((....))).))))..)))))))))((.((((.....((.((((((.(((((((..(((.......))).)).))))).)))))).)).)))))).((((((((.....(((((....)))))...((((.((((...))))..)))).....))))))))))))))))......((((....(((((...(((((....)))))....)))))....))))((((((....)))))).((((....)))).)))))))))))...((((((...))))))........)))))))))).((((((((..((...((.......))...))....)))))))).((((((..........)))))).....((((((....))))))...((((((..(((((((.(((................))))))))))..)))))))).(((((..((((.(((....)))))))......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.....,,,{(((((((((.((((((........)))))))))))))))),.((((((((((((((((((((.(((((((((({|(({...})){{((((,..............(((((.,,...(((...........)}},,..))))).((((({....}))))).........}}}}}|((((((..(((..((((.(((....))).))))..)))))))))},.,,.......{(.((((((.(((((({..(((.......))).)).))))).)))))).)}.}},},..{(((((((.....(((((....)))))...,{({.((((...))))..)))}.....)))))))))))))))}......{(((....(((((...(((((....)))))....)))))....}))}((((({....}))))),{||{.,,,)))}.}}}))))))),...||||{,...})))}}......,,}))))))))).{(((((((..((...{,.......)}...})}...)))))))}.((((((..........)))))).....((((((....))))))...((((((..(((((((.(((....,.....,,....))))))))))..)))))))).(((((..((,,{({(....)))}}),.}}.,.)))))
Forensic Context

No forensic context available.